Protein–RNA interactions for Protein: P56481

Cckbr, Gastrin/cholecystokinin type B receptor, mousemouse

Predictions only

Length 453 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CckbrP56481 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CckbrP56481 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
CckbrP56481 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CckbrP56481 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CckbrP56481 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
CckbrP56481 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CckbrP56481 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CckbrP56481 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CckbrP56481 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CckbrP56481 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CckbrP56481 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CckbrP56481 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CckbrP56481 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CckbrP56481 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CckbrP56481 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
CckbrP56481 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CckbrP56481 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CckbrP56481 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CckbrP56481 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
CckbrP56481 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CckbrP56481 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CckbrP56481 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CckbrP56481 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CckbrP56481 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CckbrP56481 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CckbrP56481 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CckbrP56481 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CckbrP56481 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CckbrP56481 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CckbrP56481 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CckbrP56481 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CckbrP56481 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CckbrP56481 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CckbrP56481 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CckbrP56481 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CckbrP56481 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CckbrP56481 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CckbrP56481 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CckbrP56481 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CckbrP56481 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CckbrP56481 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CckbrP56481 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CckbrP56481 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CckbrP56481 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CckbrP56481 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CckbrP56481 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CckbrP56481 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CckbrP56481 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CckbrP56481 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CckbrP56481 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CckbrP56481 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
CckbrP56481 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CckbrP56481 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CckbrP56481 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CckbrP56481 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CckbrP56481 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CckbrP56481 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CckbrP56481 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CckbrP56481 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CckbrP56481 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
CckbrP56481 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
CckbrP56481 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
CckbrP56481 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CckbrP56481 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CckbrP56481 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CckbrP56481 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CckbrP56481 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CckbrP56481 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CckbrP56481 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CckbrP56481 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CckbrP56481 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CckbrP56481 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CckbrP56481 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CckbrP56481 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CckbrP56481 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CckbrP56481 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CckbrP56481 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CckbrP56481 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CckbrP56481 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CckbrP56481 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CckbrP56481 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CckbrP56481 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CckbrP56481 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CckbrP56481 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CckbrP56481 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CckbrP56481 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CckbrP56481 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CckbrP56481 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CckbrP56481 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CckbrP56481 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CckbrP56481 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CckbrP56481 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CckbrP56481 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CckbrP56481 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CckbrP56481 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CckbrP56481 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CckbrP56481 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CckbrP56481 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CckbrP56481 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CckbrP56481 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 900.1 ms