Protein–RNA interactions for Protein: P56480

Atp5b, ATP synthase subunit beta, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 529 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp5bP56480 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Atp5bP56480 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Atp5bP56480 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Atp5bP56480 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Atp5bP56480 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Atp5bP56480 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Atp5bP56480 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Atp5bP56480 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Atp5bP56480 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Atp5bP56480 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Atp5bP56480 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Atp5bP56480 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Atp5bP56480 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Atp5bP56480 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Atp5bP56480 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Atp5bP56480 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Atp5bP56480 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Atp5bP56480 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Atp5bP56480 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Atp5bP56480 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Atp5bP56480 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Atp5bP56480 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Atp5bP56480 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Atp5bP56480 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Atp5bP56480 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Atp5bP56480 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Atp5bP56480 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Atp5bP56480 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Atp5bP56480 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Atp5bP56480 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Atp5bP56480 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Atp5bP56480 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Atp5bP56480 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Atp5bP56480 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Atp5bP56480 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Atp5bP56480 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Atp5bP56480 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Atp5bP56480 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Atp5bP56480 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Atp5bP56480 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Atp5bP56480 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Atp5bP56480 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Atp5bP56480 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Atp5bP56480 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Atp5bP56480 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Atp5bP56480 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Atp5bP56480 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Atp5bP56480 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Atp5bP56480 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Atp5bP56480 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Atp5bP56480 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Atp5bP56480 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Atp5bP56480 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Atp5bP56480 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Atp5bP56480 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Atp5bP56480 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Atp5bP56480 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Atp5bP56480 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Atp5bP56480 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Atp5bP56480 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Atp5bP56480 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Atp5bP56480 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Atp5bP56480 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Atp5bP56480 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Atp5bP56480 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Atp5bP56480 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Atp5bP56480 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Atp5bP56480 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Atp5bP56480 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Atp5bP56480 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Atp5bP56480 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Atp5bP56480 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Atp5bP56480 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Atp5bP56480 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Atp5bP56480 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Atp5bP56480 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Atp5bP56480 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Atp5bP56480 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Atp5bP56480 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Atp5bP56480 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Atp5bP56480 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Atp5bP56480 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Atp5bP56480 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Atp5bP56480 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Atp5bP56480 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Atp5bP56480 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Atp5bP56480 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Atp5bP56480 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Atp5bP56480 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Atp5bP56480 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Atp5bP56480 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Atp5bP56480 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Atp5bP56480 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Atp5bP56480 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Atp5bP56480 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Atp5bP56480 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Atp5bP56480 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Atp5bP56480 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Atp5bP56480 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Atp5bP56480 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.3 ms