Protein–RNA interactions for Protein: P53808

Pctp, Phosphatidylcholine transfer protein, mousemouse

Predictions only

Length 214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PctpP53808 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
PctpP53808 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
PctpP53808 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
PctpP53808 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
PctpP53808 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PctpP53808 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PctpP53808 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PctpP53808 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PctpP53808 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PctpP53808 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
PctpP53808 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PctpP53808 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
PctpP53808 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PctpP53808 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PctpP53808 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PctpP53808 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
PctpP53808 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■□□□□ 0.99
PctpP53808 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
PctpP53808 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
PctpP53808 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PctpP53808 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PctpP53808 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PctpP53808 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PctpP53808 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PctpP53808 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PctpP53808 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PctpP53808 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PctpP53808 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PctpP53808 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PctpP53808 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PctpP53808 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PctpP53808 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PctpP53808 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PctpP53808 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PctpP53808 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PctpP53808 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PctpP53808 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PctpP53808 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
PctpP53808 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PctpP53808 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PctpP53808 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
PctpP53808 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PctpP53808 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PctpP53808 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
PctpP53808 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PctpP53808 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PctpP53808 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
PctpP53808 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PctpP53808 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
PctpP53808 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PctpP53808 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PctpP53808 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PctpP53808 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
PctpP53808 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PctpP53808 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PctpP53808 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
PctpP53808 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
PctpP53808 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PctpP53808 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PctpP53808 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PctpP53808 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PctpP53808 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PctpP53808 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PctpP53808 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PctpP53808 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PctpP53808 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
PctpP53808 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
PctpP53808 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
PctpP53808 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PctpP53808 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PctpP53808 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PctpP53808 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PctpP53808 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PctpP53808 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
PctpP53808 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PctpP53808 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PctpP53808 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PctpP53808 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PctpP53808 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PctpP53808 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PctpP53808 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PctpP53808 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
PctpP53808 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PctpP53808 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PctpP53808 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PctpP53808 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
PctpP53808 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PctpP53808 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PctpP53808 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
PctpP53808 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
PctpP53808 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
PctpP53808 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
PctpP53808 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
PctpP53808 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
PctpP53808 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PctpP53808 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PctpP53808 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PctpP53808 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PctpP53808 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PctpP53808 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 98.5 ms