Protein–RNA interactions for Protein: P51180

Mip, Lens fiber major intrinsic protein, mousemouse

Predictions only

Length 263 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MipP51180 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
MipP51180 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
MipP51180 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
MipP51180 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
MipP51180 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
MipP51180 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
MipP51180 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
MipP51180 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
MipP51180 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
MipP51180 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
MipP51180 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
MipP51180 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
MipP51180 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
MipP51180 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
MipP51180 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
MipP51180 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
MipP51180 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
MipP51180 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
MipP51180 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
MipP51180 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
MipP51180 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
MipP51180 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
MipP51180 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
MipP51180 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
MipP51180 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
MipP51180 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
MipP51180 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
MipP51180 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
MipP51180 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
MipP51180 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
MipP51180 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
MipP51180 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
MipP51180 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
MipP51180 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
MipP51180 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
MipP51180 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
MipP51180 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
MipP51180 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
MipP51180 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
MipP51180 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
MipP51180 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
MipP51180 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
MipP51180 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
MipP51180 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
MipP51180 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
MipP51180 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
MipP51180 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
MipP51180 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
MipP51180 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
MipP51180 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
MipP51180 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
MipP51180 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
MipP51180 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
MipP51180 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
MipP51180 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
MipP51180 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
MipP51180 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
MipP51180 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
MipP51180 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
MipP51180 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
MipP51180 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
MipP51180 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
MipP51180 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
MipP51180 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
MipP51180 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
MipP51180 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
MipP51180 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
MipP51180 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
MipP51180 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
MipP51180 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
MipP51180 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
MipP51180 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
MipP51180 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
MipP51180 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
MipP51180 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
MipP51180 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
MipP51180 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
MipP51180 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
MipP51180 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
MipP51180 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
MipP51180 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
MipP51180 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
MipP51180 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
MipP51180 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
MipP51180 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
MipP51180 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
MipP51180 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
MipP51180 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
MipP51180 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
MipP51180 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
MipP51180 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
MipP51180 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
MipP51180 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
MipP51180 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
MipP51180 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
MipP51180 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
MipP51180 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
MipP51180 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
MipP51180 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
MipP51180 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.2 ms