Protein–RNA interactions for Protein: P50481

Lhx3, LIM/homeobox protein Lhx3, mousemouse

Predictions only

Length 400 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lhx3P50481 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Lhx3P50481 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Lhx3P50481 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Lhx3P50481 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Lhx3P50481 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Lhx3P50481 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Lhx3P50481 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Lhx3P50481 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Lhx3P50481 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Lhx3P50481 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Lhx3P50481 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Lhx3P50481 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Lhx3P50481 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Lhx3P50481 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Lhx3P50481 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Lhx3P50481 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Lhx3P50481 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Lhx3P50481 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Lhx3P50481 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Lhx3P50481 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Lhx3P50481 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Lhx3P50481 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Lhx3P50481 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Lhx3P50481 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Lhx3P50481 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Lhx3P50481 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Lhx3P50481 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Lhx3P50481 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Lhx3P50481 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Lhx3P50481 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Lhx3P50481 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Lhx3P50481 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Lhx3P50481 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Lhx3P50481 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Lhx3P50481 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Lhx3P50481 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Lhx3P50481 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Lhx3P50481 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Lhx3P50481 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Lhx3P50481 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Lhx3P50481 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Lhx3P50481 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Lhx3P50481 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Lhx3P50481 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Lhx3P50481 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Lhx3P50481 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Lhx3P50481 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Lhx3P50481 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Lhx3P50481 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Lhx3P50481 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Lhx3P50481 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Lhx3P50481 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Lhx3P50481 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Lhx3P50481 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Lhx3P50481 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Lhx3P50481 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Lhx3P50481 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Lhx3P50481 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Lhx3P50481 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Lhx3P50481 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Lhx3P50481 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Lhx3P50481 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Lhx3P50481 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Lhx3P50481 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Lhx3P50481 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Lhx3P50481 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Lhx3P50481 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Lhx3P50481 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Lhx3P50481 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Lhx3P50481 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Lhx3P50481 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Lhx3P50481 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Lhx3P50481 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Lhx3P50481 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Lhx3P50481 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Lhx3P50481 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Lhx3P50481 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Lhx3P50481 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Lhx3P50481 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Lhx3P50481 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Lhx3P50481 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Lhx3P50481 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Lhx3P50481 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Lhx3P50481 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Lhx3P50481 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Lhx3P50481 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Lhx3P50481 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Lhx3P50481 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Lhx3P50481 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Lhx3P50481 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Lhx3P50481 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Lhx3P50481 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Lhx3P50481 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Lhx3P50481 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Lhx3P50481 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Lhx3P50481 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Lhx3P50481 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Lhx3P50481 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Lhx3P50481 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Lhx3P50481 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.2 ms