Protein–RNA interactions for Protein: P50396

Gdi1, Rab GDP dissociation inhibitor alpha, mousemouse

Predictions only

Length 447 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gdi1P50396 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Gdi1P50396 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Gdi1P50396 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Gdi1P50396 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Gdi1P50396 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Gdi1P50396 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Gdi1P50396 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Gdi1P50396 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Gdi1P50396 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Gdi1P50396 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Gdi1P50396 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Gdi1P50396 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Gdi1P50396 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Gdi1P50396 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Gdi1P50396 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Gdi1P50396 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Gdi1P50396 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Gdi1P50396 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Gdi1P50396 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Gdi1P50396 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Gdi1P50396 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Gdi1P50396 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Gdi1P50396 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Gdi1P50396 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Gdi1P50396 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Gdi1P50396 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Gdi1P50396 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Gdi1P50396 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Gdi1P50396 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Gdi1P50396 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Gdi1P50396 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Gdi1P50396 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Gdi1P50396 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Gdi1P50396 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Gdi1P50396 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Gdi1P50396 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Gdi1P50396 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Gdi1P50396 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Gdi1P50396 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Gdi1P50396 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Gdi1P50396 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Gdi1P50396 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
Gdi1P50396 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Gdi1P50396 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Gdi1P50396 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Gdi1P50396 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC21.83■■□□□ 1.08
Gdi1P50396 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Gdi1P50396 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Gdi1P50396 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Gdi1P50396 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Gdi1P50396 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Gdi1P50396 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Gdi1P50396 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Gdi1P50396 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Gdi1P50396 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Gdi1P50396 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Gdi1P50396 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Gdi1P50396 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Gdi1P50396 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Gdi1P50396 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Gdi1P50396 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Gdi1P50396 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Gdi1P50396 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Gdi1P50396 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Gdi1P50396 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Gdi1P50396 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Gdi1P50396 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Gdi1P50396 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Gdi1P50396 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Gdi1P50396 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Gdi1P50396 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Gdi1P50396 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.07
Gdi1P50396 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Gdi1P50396 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Gdi1P50396 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Gdi1P50396 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Gdi1P50396 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Gdi1P50396 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Gdi1P50396 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Gdi1P50396 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Gdi1P50396 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Gdi1P50396 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Gdi1P50396 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Gdi1P50396 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Gdi1P50396 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Gdi1P50396 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Gdi1P50396 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Gdi1P50396 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Gdi1P50396 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Gdi1P50396 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Gdi1P50396 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Gdi1P50396 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Gdi1P50396 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Gdi1P50396 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Gdi1P50396 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Gdi1P50396 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Gdi1P50396 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Gdi1P50396 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Gdi1P50396 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Gdi1P50396 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.8 ms