Protein–RNA interactions for Protein: P49135

Ercc3, General transcription and DNA repair factor IIH helicase subunit XPB, mousemouse

Predictions only

Length 783 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ercc3P49135 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Ercc3P49135 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Ercc3P49135 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Ercc3P49135 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Ercc3P49135 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Ercc3P49135 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Ercc3P49135 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Ercc3P49135 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Ercc3P49135 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Ercc3P49135 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Ercc3P49135 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
Ercc3P49135 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Ercc3P49135 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Ercc3P49135 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Ercc3P49135 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Ercc3P49135 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Ercc3P49135 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Ercc3P49135 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Ercc3P49135 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Ercc3P49135 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Ercc3P49135 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Ercc3P49135 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Ercc3P49135 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Ercc3P49135 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Ercc3P49135 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Ercc3P49135 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Ercc3P49135 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Ercc3P49135 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Ercc3P49135 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Ercc3P49135 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Ercc3P49135 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Ercc3P49135 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Ercc3P49135 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Ercc3P49135 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Ercc3P49135 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Ercc3P49135 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Ercc3P49135 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Ercc3P49135 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Ercc3P49135 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Ercc3P49135 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Ercc3P49135 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Ercc3P49135 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Ercc3P49135 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Ercc3P49135 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Ercc3P49135 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Ercc3P49135 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Ercc3P49135 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Ercc3P49135 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Ercc3P49135 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Ercc3P49135 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Ercc3P49135 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Ercc3P49135 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
Ercc3P49135 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Ercc3P49135 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Ercc3P49135 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Ercc3P49135 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Ercc3P49135 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Ercc3P49135 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Ercc3P49135 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Ercc3P49135 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Ercc3P49135 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Ercc3P49135 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Ercc3P49135 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Ercc3P49135 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Ercc3P49135 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Ercc3P49135 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Ercc3P49135 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Ercc3P49135 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Ercc3P49135 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Ercc3P49135 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Ercc3P49135 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
Ercc3P49135 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Ercc3P49135 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Ercc3P49135 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Ercc3P49135 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Ercc3P49135 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Ercc3P49135 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Ercc3P49135 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Ercc3P49135 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Ercc3P49135 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Ercc3P49135 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Ercc3P49135 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Ercc3P49135 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Ercc3P49135 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Ercc3P49135 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Ercc3P49135 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Ercc3P49135 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Ercc3P49135 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Ercc3P49135 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Ercc3P49135 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Ercc3P49135 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Ercc3P49135 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
Ercc3P49135 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Ercc3P49135 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Ercc3P49135 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
Ercc3P49135 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Ercc3P49135 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
Ercc3P49135 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Ercc3P49135 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Ercc3P49135 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.6 ms