Protein–RNA interactions for Protein: P48985

Atoh1, Protein atonal homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 351 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atoh1P48985 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Atoh1P48985 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Atoh1P48985 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Atoh1P48985 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Atoh1P48985 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Atoh1P48985 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Atoh1P48985 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Atoh1P48985 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Atoh1P48985 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Atoh1P48985 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Atoh1P48985 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Atoh1P48985 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Atoh1P48985 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Atoh1P48985 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Atoh1P48985 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Atoh1P48985 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Atoh1P48985 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
Atoh1P48985 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Atoh1P48985 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Atoh1P48985 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Atoh1P48985 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Atoh1P48985 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Atoh1P48985 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
Atoh1P48985 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Atoh1P48985 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
Atoh1P48985 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Atoh1P48985 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Atoh1P48985 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Atoh1P48985 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Atoh1P48985 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Atoh1P48985 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Atoh1P48985 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Atoh1P48985 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Atoh1P48985 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Atoh1P48985 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Atoh1P48985 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Atoh1P48985 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Atoh1P48985 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Atoh1P48985 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Atoh1P48985 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Atoh1P48985 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Atoh1P48985 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Atoh1P48985 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.6
Atoh1P48985 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Atoh1P48985 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Atoh1P48985 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Atoh1P48985 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
Atoh1P48985 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Atoh1P48985 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
Atoh1P48985 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Atoh1P48985 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Atoh1P48985 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Atoh1P48985 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
Atoh1P48985 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Atoh1P48985 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Atoh1P48985 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Atoh1P48985 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Atoh1P48985 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Atoh1P48985 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Atoh1P48985 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Atoh1P48985 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Atoh1P48985 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Atoh1P48985 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Atoh1P48985 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Atoh1P48985 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Atoh1P48985 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Atoh1P48985 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
Atoh1P48985 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
Atoh1P48985 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Atoh1P48985 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Atoh1P48985 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Atoh1P48985 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Atoh1P48985 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Atoh1P48985 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Atoh1P48985 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Atoh1P48985 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Atoh1P48985 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Atoh1P48985 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Atoh1P48985 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Atoh1P48985 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Atoh1P48985 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Atoh1P48985 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
Atoh1P48985 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
Atoh1P48985 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Atoh1P48985 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Atoh1P48985 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Atoh1P48985 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Atoh1P48985 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
Atoh1P48985 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Atoh1P48985 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Atoh1P48985 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Atoh1P48985 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Atoh1P48985 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Atoh1P48985 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Atoh1P48985 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Atoh1P48985 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Atoh1P48985 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Atoh1P48985 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Atoh1P48985 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Atoh1P48985 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.2 ms