Protein–RNA interactions for Protein: P47934

Crat, Carnitine O-acetyltransferase, mousemouse

Predictions only

Length 626 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CratP47934 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CratP47934 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CratP47934 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CratP47934 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CratP47934 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CratP47934 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
CratP47934 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CratP47934 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CratP47934 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CratP47934 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CratP47934 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CratP47934 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CratP47934 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CratP47934 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CratP47934 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CratP47934 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CratP47934 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CratP47934 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CratP47934 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CratP47934 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CratP47934 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CratP47934 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CratP47934 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CratP47934 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CratP47934 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CratP47934 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CratP47934 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CratP47934 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CratP47934 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CratP47934 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CratP47934 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CratP47934 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CratP47934 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CratP47934 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CratP47934 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CratP47934 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CratP47934 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CratP47934 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CratP47934 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CratP47934 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CratP47934 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CratP47934 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
CratP47934 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
CratP47934 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CratP47934 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CratP47934 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CratP47934 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CratP47934 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CratP47934 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CratP47934 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CratP47934 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
CratP47934 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CratP47934 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CratP47934 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CratP47934 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CratP47934 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CratP47934 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CratP47934 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CratP47934 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CratP47934 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CratP47934 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CratP47934 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CratP47934 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CratP47934 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CratP47934 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CratP47934 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CratP47934 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CratP47934 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CratP47934 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CratP47934 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CratP47934 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CratP47934 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CratP47934 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CratP47934 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CratP47934 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
CratP47934 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CratP47934 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CratP47934 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CratP47934 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CratP47934 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
CratP47934 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CratP47934 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CratP47934 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CratP47934 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CratP47934 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CratP47934 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CratP47934 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CratP47934 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CratP47934 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC21■□□□□ 0.95
CratP47934 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CratP47934 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CratP47934 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CratP47934 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CratP47934 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
CratP47934 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
CratP47934 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
CratP47934 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
CratP47934 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CratP47934 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
CratP47934 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 85.1 ms