Protein–RNA interactions for Protein: P46684

Zic1, Zinc finger protein ZIC 1, mousemouse

Predictions only

Length 447 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zic1P46684 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Zic1P46684 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Zic1P46684 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Zic1P46684 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Zic1P46684 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Zic1P46684 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Zic1P46684 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Zic1P46684 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Zic1P46684 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Zic1P46684 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Zic1P46684 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Zic1P46684 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Zic1P46684 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Zic1P46684 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Zic1P46684 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Zic1P46684 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Zic1P46684 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Zic1P46684 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Zic1P46684 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Zic1P46684 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Zic1P46684 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Zic1P46684 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Zic1P46684 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Zic1P46684 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Zic1P46684 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Zic1P46684 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Zic1P46684 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Zic1P46684 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Zic1P46684 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Zic1P46684 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Zic1P46684 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Zic1P46684 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Zic1P46684 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Zic1P46684 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Zic1P46684 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Zic1P46684 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Zic1P46684 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Zic1P46684 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Zic1P46684 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Zic1P46684 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Zic1P46684 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Zic1P46684 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Zic1P46684 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Zic1P46684 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Zic1P46684 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Zic1P46684 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Zic1P46684 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Zic1P46684 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Zic1P46684 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Zic1P46684 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Zic1P46684 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Zic1P46684 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Zic1P46684 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Zic1P46684 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Zic1P46684 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Zic1P46684 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Zic1P46684 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Zic1P46684 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Zic1P46684 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Zic1P46684 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Zic1P46684 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Zic1P46684 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Zic1P46684 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Zic1P46684 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Zic1P46684 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Zic1P46684 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Zic1P46684 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Zic1P46684 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Zic1P46684 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Zic1P46684 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Zic1P46684 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Zic1P46684 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Zic1P46684 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Zic1P46684 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Zic1P46684 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC21■□□□□ 0.95
Zic1P46684 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Zic1P46684 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Zic1P46684 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Zic1P46684 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Zic1P46684 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Zic1P46684 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Zic1P46684 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Zic1P46684 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Zic1P46684 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Zic1P46684 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Zic1P46684 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Zic1P46684 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Zic1P46684 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Zic1P46684 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Zic1P46684 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Zic1P46684 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Zic1P46684 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Zic1P46684 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Zic1P46684 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Zic1P46684 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Zic1P46684 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Zic1P46684 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Zic1P46684 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Zic1P46684 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Zic1P46684 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.6 ms