Protein–RNA interactions for Protein: P46414

Cdkn1b, Cyclin-dependent kinase inhibitor 1B, mousemouse

Predictions only

Length 197 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdkn1bP46414 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cdkn1bP46414 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cdkn1bP46414 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cdkn1bP46414 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cdkn1bP46414 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cdkn1bP46414 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cdkn1bP46414 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cdkn1bP46414 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cdkn1bP46414 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cdkn1bP46414 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cdkn1bP46414 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cdkn1bP46414 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cdkn1bP46414 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cdkn1bP46414 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cdkn1bP46414 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cdkn1bP46414 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Cdkn1bP46414 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cdkn1bP46414 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cdkn1bP46414 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cdkn1bP46414 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cdkn1bP46414 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cdkn1bP46414 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cdkn1bP46414 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cdkn1bP46414 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cdkn1bP46414 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cdkn1bP46414 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cdkn1bP46414 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cdkn1bP46414 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cdkn1bP46414 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cdkn1bP46414 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cdkn1bP46414 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cdkn1bP46414 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cdkn1bP46414 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cdkn1bP46414 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cdkn1bP46414 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Cdkn1bP46414 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Cdkn1bP46414 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Cdkn1bP46414 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Cdkn1bP46414 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Cdkn1bP46414 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Cdkn1bP46414 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cdkn1bP46414 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cdkn1bP46414 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cdkn1bP46414 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cdkn1bP46414 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cdkn1bP46414 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Cdkn1bP46414 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cdkn1bP46414 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cdkn1bP46414 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cdkn1bP46414 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cdkn1bP46414 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cdkn1bP46414 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cdkn1bP46414 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cdkn1bP46414 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cdkn1bP46414 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cdkn1bP46414 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cdkn1bP46414 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Cdkn1bP46414 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Cdkn1bP46414 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Cdkn1bP46414 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Cdkn1bP46414 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Cdkn1bP46414 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Cdkn1bP46414 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Cdkn1bP46414 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Cdkn1bP46414 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Cdkn1bP46414 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Cdkn1bP46414 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Cdkn1bP46414 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Cdkn1bP46414 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Cdkn1bP46414 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Cdkn1bP46414 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Cdkn1bP46414 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Cdkn1bP46414 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cdkn1bP46414 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cdkn1bP46414 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cdkn1bP46414 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cdkn1bP46414 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cdkn1bP46414 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cdkn1bP46414 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cdkn1bP46414 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cdkn1bP46414 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cdkn1bP46414 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cdkn1bP46414 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cdkn1bP46414 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cdkn1bP46414 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cdkn1bP46414 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cdkn1bP46414 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cdkn1bP46414 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cdkn1bP46414 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cdkn1bP46414 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cdkn1bP46414 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cdkn1bP46414 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cdkn1bP46414 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cdkn1bP46414 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cdkn1bP46414 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cdkn1bP46414 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cdkn1bP46414 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cdkn1bP46414 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cdkn1bP46414 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cdkn1bP46414 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.9 ms