Protein–RNA interactions for Protein: P43006

Slc1a2, Excitatory amino acid transporter 2, mousemouse

Predictions only

Length 572 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc1a2P43006 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Slc1a2P43006 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Slc1a2P43006 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Slc1a2P43006 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Slc1a2P43006 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Slc1a2P43006 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Slc1a2P43006 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Slc1a2P43006 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Slc1a2P43006 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Slc1a2P43006 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Slc1a2P43006 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Slc1a2P43006 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Slc1a2P43006 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Slc1a2P43006 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Slc1a2P43006 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Slc1a2P43006 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Slc1a2P43006 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Slc1a2P43006 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Slc1a2P43006 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Slc1a2P43006 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Slc1a2P43006 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Slc1a2P43006 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Slc1a2P43006 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Slc1a2P43006 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Slc1a2P43006 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Slc1a2P43006 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Slc1a2P43006 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Slc1a2P43006 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Slc1a2P43006 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Slc1a2P43006 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Slc1a2P43006 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Slc1a2P43006 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Slc1a2P43006 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Slc1a2P43006 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Slc1a2P43006 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Slc1a2P43006 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Slc1a2P43006 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Slc1a2P43006 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Slc1a2P43006 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Slc1a2P43006 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Slc1a2P43006 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Slc1a2P43006 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Slc1a2P43006 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Slc1a2P43006 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Slc1a2P43006 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Slc1a2P43006 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Slc1a2P43006 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Slc1a2P43006 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Slc1a2P43006 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Slc1a2P43006 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Slc1a2P43006 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Slc1a2P43006 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Slc1a2P43006 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Slc1a2P43006 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Slc1a2P43006 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Slc1a2P43006 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Slc1a2P43006 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Slc1a2P43006 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Slc1a2P43006 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Slc1a2P43006 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Slc1a2P43006 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Slc1a2P43006 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Slc1a2P43006 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Slc1a2P43006 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Slc1a2P43006 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Slc1a2P43006 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Slc1a2P43006 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Slc1a2P43006 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Slc1a2P43006 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Slc1a2P43006 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Slc1a2P43006 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Slc1a2P43006 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Slc1a2P43006 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Slc1a2P43006 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Slc1a2P43006 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Slc1a2P43006 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Slc1a2P43006 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Slc1a2P43006 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Slc1a2P43006 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Slc1a2P43006 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Slc1a2P43006 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Slc1a2P43006 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Slc1a2P43006 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Slc1a2P43006 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Slc1a2P43006 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Slc1a2P43006 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Slc1a2P43006 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Slc1a2P43006 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Slc1a2P43006 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Slc1a2P43006 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Slc1a2P43006 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Slc1a2P43006 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Slc1a2P43006 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Slc1a2P43006 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Slc1a2P43006 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Slc1a2P43006 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Slc1a2P43006 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Slc1a2P43006 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Slc1a2P43006 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Slc1a2P43006 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.7 ms