Protein–RNA interactions for Protein: P42582

Nkx2-5, Homeobox protein Nkx-2.5, mousemouse

Predictions only

Length 318 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nkx2-5P42582 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Nkx2-5P42582 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Nkx2-5P42582 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Nkx2-5P42582 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Nkx2-5P42582 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Nkx2-5P42582 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Nkx2-5P42582 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Nkx2-5P42582 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Nkx2-5P42582 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Nkx2-5P42582 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Nkx2-5P42582 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Nkx2-5P42582 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Nkx2-5P42582 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Nkx2-5P42582 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Nkx2-5P42582 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Nkx2-5P42582 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Nkx2-5P42582 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Nkx2-5P42582 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Nkx2-5P42582 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Nkx2-5P42582 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Nkx2-5P42582 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Nkx2-5P42582 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Nkx2-5P42582 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Nkx2-5P42582 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Nkx2-5P42582 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Nkx2-5P42582 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Nkx2-5P42582 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Nkx2-5P42582 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Nkx2-5P42582 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Nkx2-5P42582 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Nkx2-5P42582 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Nkx2-5P42582 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Nkx2-5P42582 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Nkx2-5P42582 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Nkx2-5P42582 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Nkx2-5P42582 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Nkx2-5P42582 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Nkx2-5P42582 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Nkx2-5P42582 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Nkx2-5P42582 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Nkx2-5P42582 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Nkx2-5P42582 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Nkx2-5P42582 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Nkx2-5P42582 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Nkx2-5P42582 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Nkx2-5P42582 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Nkx2-5P42582 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Nkx2-5P42582 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Nkx2-5P42582 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Nkx2-5P42582 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Nkx2-5P42582 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Nkx2-5P42582 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Nkx2-5P42582 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Nkx2-5P42582 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Nkx2-5P42582 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Nkx2-5P42582 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Nkx2-5P42582 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Nkx2-5P42582 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Nkx2-5P42582 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Nkx2-5P42582 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC23.08■■□□□ 1.28
Nkx2-5P42582 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC23.08■■□□□ 1.28
Nkx2-5P42582 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
Nkx2-5P42582 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Nkx2-5P42582 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Nkx2-5P42582 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Nkx2-5P42582 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Nkx2-5P42582 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Nkx2-5P42582 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Nkx2-5P42582 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Nkx2-5P42582 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Nkx2-5P42582 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Nkx2-5P42582 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Nkx2-5P42582 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Nkx2-5P42582 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Nkx2-5P42582 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Nkx2-5P42582 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Nkx2-5P42582 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Nkx2-5P42582 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Nkx2-5P42582 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Nkx2-5P42582 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Nkx2-5P42582 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Nkx2-5P42582 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Nkx2-5P42582 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Nkx2-5P42582 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Nkx2-5P42582 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Nkx2-5P42582 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Nkx2-5P42582 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Nkx2-5P42582 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Nkx2-5P42582 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Nkx2-5P42582 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Nkx2-5P42582 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Nkx2-5P42582 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Nkx2-5P42582 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Nkx2-5P42582 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Nkx2-5P42582 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Nkx2-5P42582 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Nkx2-5P42582 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Nkx2-5P42582 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Nkx2-5P42582 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
Nkx2-5P42582 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.8 ms