Protein–RNA interactions for Protein: P40201

Chd1, Chromodomain-helicase-DNA-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,711 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chd1P40201 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.52■■■■□ 3.12
Chd1P40201 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.52■■■■□ 3.12
Chd1P40201 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.51■■■■□ 3.12
Chd1P40201 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC34.51■■■■□ 3.12
Chd1P40201 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.5■■■■□ 3.11
Chd1P40201 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC34.5■■■■□ 3.11
Chd1P40201 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.5■■■■□ 3.11
Chd1P40201 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.49■■■■□ 3.11
Chd1P40201 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.49■■■■□ 3.11
Chd1P40201 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.48■■■■□ 3.11
Chd1P40201 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.48■■■■□ 3.11
Chd1P40201 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC34.47■■■■□ 3.11
Chd1P40201 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC34.46■■■■□ 3.11
Chd1P40201 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC34.46■■■■□ 3.11
Chd1P40201 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC34.46■■■■□ 3.11
Chd1P40201 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.45■■■■□ 3.11
Chd1P40201 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.45■■■■□ 3.1
Chd1P40201 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.44■■■■□ 3.1
Chd1P40201 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC34.44■■■■□ 3.1
Chd1P40201 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC34.44■■■■□ 3.1
Chd1P40201 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC34.44■■■■□ 3.1
Chd1P40201 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.43■■■■□ 3.1
Chd1P40201 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.43■■■■□ 3.1
Chd1P40201 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC34.42■■■■□ 3.1
Chd1P40201 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC34.42■■■■□ 3.1
Chd1P40201 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC34.42■■■■□ 3.1
Chd1P40201 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC34.41■■■■□ 3.1
Chd1P40201 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC34.41■■■■□ 3.1
Chd1P40201 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1
Chd1P40201 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1
Chd1P40201 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
Chd1P40201 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
Chd1P40201 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
Chd1P40201 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC34.4■■■■□ 3.1
Chd1P40201 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.4■■■■□ 3.1
Chd1P40201 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC34.4■■■■□ 3.1
Chd1P40201 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
Chd1P40201 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
Chd1P40201 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
Chd1P40201 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC34.39■■■■□ 3.1
Chd1P40201 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.38■■■■□ 3.09
Chd1P40201 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.38■■■■□ 3.09
Chd1P40201 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC34.38■■■■□ 3.09
Chd1P40201 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.38■■■■□ 3.09
Chd1P40201 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC34.38■■■■□ 3.09
Chd1P40201 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC34.38■■■■□ 3.09
Chd1P40201 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.37■■■■□ 3.09
Chd1P40201 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
Chd1P40201 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
Chd1P40201 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
Chd1P40201 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
Chd1P40201 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
Chd1P40201 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
Chd1P40201 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
Chd1P40201 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
Chd1P40201 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC34.34■■■■□ 3.09
Chd1P40201 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC34.34■■■■□ 3.09
Chd1P40201 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.34■■■■□ 3.09
Chd1P40201 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
Chd1P40201 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
Chd1P40201 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
Chd1P40201 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC34.33■■■■□ 3.09
Chd1P40201 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC34.33■■■■□ 3.09
Chd1P40201 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
Chd1P40201 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC34.31■■■■□ 3.08
Chd1P40201 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC34.31■■■■□ 3.08
Chd1P40201 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
Chd1P40201 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC34.31■■■■□ 3.08
Chd1P40201 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
Chd1P40201 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
Chd1P40201 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
Chd1P40201 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
Chd1P40201 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
Chd1P40201 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC34.29■■■■□ 3.08
Chd1P40201 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.29■■■■□ 3.08
Chd1P40201 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
Chd1P40201 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
Chd1P40201 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
Chd1P40201 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC34.27■■■■□ 3.08
Chd1P40201 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC34.27■■■■□ 3.08
Chd1P40201 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC34.27■■■■□ 3.08
Chd1P40201 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC34.27■■■■□ 3.08
Chd1P40201 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC34.26■■■■□ 3.08
Chd1P40201 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC34.26■■■■□ 3.07
Chd1P40201 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC34.26■■■■□ 3.07
Chd1P40201 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC34.26■■■■□ 3.07
Chd1P40201 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
Chd1P40201 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC34.25■■■■□ 3.07
Chd1P40201 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.24■■■■□ 3.07
Chd1P40201 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC34.24■■■■□ 3.07
Chd1P40201 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC34.24■■■■□ 3.07
Chd1P40201 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC34.24■■■■□ 3.07
Chd1P40201 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.24■■■■□ 3.07
Chd1P40201 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC34.23■■■■□ 3.07
Chd1P40201 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
Chd1P40201 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC34.22■■■■□ 3.07
Chd1P40201 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC34.22■■■■□ 3.07
Chd1P40201 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC34.22■■■■□ 3.07
Chd1P40201 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
Chd1P40201 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.2 ms