Protein–RNA interactions for Protein: P35846

Folr1, Folate receptor alpha, mousemouse

Predictions only

Length 255 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Folr1P35846 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Folr1P35846 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Folr1P35846 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Folr1P35846 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Folr1P35846 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Folr1P35846 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Folr1P35846 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Folr1P35846 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Folr1P35846 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Folr1P35846 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Folr1P35846 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Folr1P35846 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Folr1P35846 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Folr1P35846 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Folr1P35846 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Folr1P35846 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Folr1P35846 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Folr1P35846 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Folr1P35846 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Folr1P35846 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Folr1P35846 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Folr1P35846 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Folr1P35846 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Folr1P35846 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Folr1P35846 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Folr1P35846 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Folr1P35846 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Folr1P35846 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Folr1P35846 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Folr1P35846 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Folr1P35846 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Folr1P35846 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Folr1P35846 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Folr1P35846 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Folr1P35846 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Folr1P35846 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Folr1P35846 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Folr1P35846 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Folr1P35846 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Folr1P35846 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Folr1P35846 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Folr1P35846 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Folr1P35846 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Folr1P35846 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Folr1P35846 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Folr1P35846 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Folr1P35846 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Folr1P35846 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Folr1P35846 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Folr1P35846 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Folr1P35846 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Folr1P35846 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Folr1P35846 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Folr1P35846 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Folr1P35846 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Folr1P35846 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Folr1P35846 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Folr1P35846 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Folr1P35846 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Folr1P35846 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Folr1P35846 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Folr1P35846 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Folr1P35846 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Folr1P35846 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Folr1P35846 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Folr1P35846 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Folr1P35846 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Folr1P35846 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Folr1P35846 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Folr1P35846 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Folr1P35846 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Folr1P35846 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Folr1P35846 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Folr1P35846 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Folr1P35846 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Folr1P35846 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Folr1P35846 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Folr1P35846 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
Folr1P35846 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Folr1P35846 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Folr1P35846 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Folr1P35846 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Folr1P35846 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Folr1P35846 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Folr1P35846 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Folr1P35846 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Folr1P35846 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Folr1P35846 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Folr1P35846 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Folr1P35846 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Folr1P35846 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Folr1P35846 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Folr1P35846 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Folr1P35846 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Folr1P35846 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Folr1P35846 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Folr1P35846 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Folr1P35846 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Folr1P35846 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Folr1P35846 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.2 ms