Protein–RNA interactions for Protein: P35242

Sftpa1, Pulmonary surfactant-associated protein A, mousemouse

Predictions only

Length 248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sftpa1P35242 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Sftpa1P35242 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Sftpa1P35242 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Sftpa1P35242 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Sftpa1P35242 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Sftpa1P35242 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Sftpa1P35242 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Sftpa1P35242 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Sftpa1P35242 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Sftpa1P35242 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Sftpa1P35242 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Sftpa1P35242 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Sftpa1P35242 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Sftpa1P35242 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Sftpa1P35242 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
Sftpa1P35242 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Sftpa1P35242 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Sftpa1P35242 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Sftpa1P35242 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Sftpa1P35242 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Sftpa1P35242 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Sftpa1P35242 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Sftpa1P35242 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Sftpa1P35242 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Sftpa1P35242 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Sftpa1P35242 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Sftpa1P35242 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Sftpa1P35242 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Sftpa1P35242 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Sftpa1P35242 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Sftpa1P35242 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Sftpa1P35242 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Sftpa1P35242 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Sftpa1P35242 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Sftpa1P35242 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Sftpa1P35242 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Sftpa1P35242 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Sftpa1P35242 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Sftpa1P35242 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Sftpa1P35242 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Sftpa1P35242 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Sftpa1P35242 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Sftpa1P35242 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Sftpa1P35242 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Sftpa1P35242 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Sftpa1P35242 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Sftpa1P35242 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Sftpa1P35242 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Sftpa1P35242 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Sftpa1P35242 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Sftpa1P35242 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Sftpa1P35242 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Sftpa1P35242 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Sftpa1P35242 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Sftpa1P35242 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Sftpa1P35242 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Sftpa1P35242 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Sftpa1P35242 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Sftpa1P35242 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Sftpa1P35242 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Sftpa1P35242 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Sftpa1P35242 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Sftpa1P35242 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Sftpa1P35242 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Sftpa1P35242 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Sftpa1P35242 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Sftpa1P35242 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Sftpa1P35242 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Sftpa1P35242 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Sftpa1P35242 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Sftpa1P35242 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Sftpa1P35242 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Sftpa1P35242 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Sftpa1P35242 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Sftpa1P35242 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Sftpa1P35242 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Sftpa1P35242 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Sftpa1P35242 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Sftpa1P35242 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Sftpa1P35242 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Sftpa1P35242 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Sftpa1P35242 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Sftpa1P35242 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Sftpa1P35242 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Sftpa1P35242 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Sftpa1P35242 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Sftpa1P35242 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Sftpa1P35242 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Sftpa1P35242 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Sftpa1P35242 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Sftpa1P35242 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Sftpa1P35242 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Sftpa1P35242 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Sftpa1P35242 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Sftpa1P35242 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Sftpa1P35242 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Sftpa1P35242 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Sftpa1P35242 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Sftpa1P35242 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Sftpa1P35242 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.4 ms