Protein–RNA interactions for Protein: P32067

Ssb, Lupus La protein homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 415 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SsbP32067 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SsbP32067 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SsbP32067 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
SsbP32067 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SsbP32067 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SsbP32067 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SsbP32067 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
SsbP32067 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SsbP32067 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SsbP32067 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
SsbP32067 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SsbP32067 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SsbP32067 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SsbP32067 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SsbP32067 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SsbP32067 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SsbP32067 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SsbP32067 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SsbP32067 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SsbP32067 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SsbP32067 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SsbP32067 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SsbP32067 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SsbP32067 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SsbP32067 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SsbP32067 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SsbP32067 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SsbP32067 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SsbP32067 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
SsbP32067 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
SsbP32067 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
SsbP32067 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
SsbP32067 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
SsbP32067 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
SsbP32067 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
SsbP32067 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
SsbP32067 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SsbP32067 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SsbP32067 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SsbP32067 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.49
SsbP32067 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SsbP32067 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SsbP32067 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SsbP32067 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SsbP32067 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SsbP32067 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SsbP32067 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SsbP32067 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SsbP32067 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SsbP32067 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SsbP32067 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SsbP32067 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SsbP32067 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SsbP32067 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SsbP32067 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SsbP32067 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SsbP32067 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SsbP32067 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SsbP32067 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SsbP32067 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SsbP32067 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SsbP32067 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SsbP32067 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SsbP32067 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SsbP32067 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SsbP32067 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SsbP32067 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SsbP32067 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SsbP32067 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
SsbP32067 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SsbP32067 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SsbP32067 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SsbP32067 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SsbP32067 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SsbP32067 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SsbP32067 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SsbP32067 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SsbP32067 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SsbP32067 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SsbP32067 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
SsbP32067 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
SsbP32067 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SsbP32067 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SsbP32067 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SsbP32067 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SsbP32067 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
SsbP32067 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SsbP32067 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SsbP32067 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SsbP32067 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SsbP32067 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SsbP32067 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SsbP32067 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SsbP32067 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SsbP32067 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SsbP32067 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SsbP32067 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SsbP32067 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
SsbP32067 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SsbP32067 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.8 ms