Protein–RNA interactions for Protein: P30658

Cbx2, Chromobox protein homolog 2, mousemouse

Predictions only

Length 519 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cbx2P30658 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Cbx2P30658 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Cbx2P30658 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Cbx2P30658 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Cbx2P30658 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Cbx2P30658 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Cbx2P30658 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Cbx2P30658 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Cbx2P30658 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Cbx2P30658 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
Cbx2P30658 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Cbx2P30658 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Cbx2P30658 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Cbx2P30658 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Cbx2P30658 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Cbx2P30658 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Cbx2P30658 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Cbx2P30658 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Cbx2P30658 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Cbx2P30658 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Cbx2P30658 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
Cbx2P30658 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
Cbx2P30658 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Cbx2P30658 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Cbx2P30658 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
Cbx2P30658 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Cbx2P30658 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Cbx2P30658 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Cbx2P30658 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
Cbx2P30658 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Cbx2P30658 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Cbx2P30658 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
Cbx2P30658 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Cbx2P30658 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Cbx2P30658 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Cbx2P30658 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Cbx2P30658 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Cbx2P30658 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Cbx2P30658 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Cbx2P30658 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Cbx2P30658 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Cbx2P30658 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Cbx2P30658 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Cbx2P30658 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Cbx2P30658 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Cbx2P30658 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Cbx2P30658 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Cbx2P30658 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Cbx2P30658 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Cbx2P30658 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Cbx2P30658 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.6
Cbx2P30658 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC25.08■■□□□ 1.6
Cbx2P30658 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Cbx2P30658 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Cbx2P30658 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Cbx2P30658 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Cbx2P30658 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Cbx2P30658 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Cbx2P30658 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Cbx2P30658 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Cbx2P30658 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
Cbx2P30658 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Cbx2P30658 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Cbx2P30658 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Cbx2P30658 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Cbx2P30658 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Cbx2P30658 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Cbx2P30658 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Cbx2P30658 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Cbx2P30658 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Cbx2P30658 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Cbx2P30658 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Cbx2P30658 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Cbx2P30658 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Cbx2P30658 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Cbx2P30658 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Cbx2P30658 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Cbx2P30658 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Cbx2P30658 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Cbx2P30658 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Cbx2P30658 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
Cbx2P30658 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
Cbx2P30658 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Cbx2P30658 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Cbx2P30658 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Cbx2P30658 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Cbx2P30658 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Cbx2P30658 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Cbx2P30658 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Cbx2P30658 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC25■■□□□ 1.59
Cbx2P30658 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC25■■□□□ 1.59
Cbx2P30658 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
Cbx2P30658 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Cbx2P30658 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Cbx2P30658 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Cbx2P30658 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Cbx2P30658 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Cbx2P30658 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Cbx2P30658 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Cbx2P30658 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 82.2 ms