Protein–RNA interactions for Protein: P28867

Prkcd, Protein kinase C delta type, mousemouse

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Length 674 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkcdP28867 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
PrkcdP28867 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PrkcdP28867 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PrkcdP28867 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PrkcdP28867 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
PrkcdP28867 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PrkcdP28867 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PrkcdP28867 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PrkcdP28867 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PrkcdP28867 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PrkcdP28867 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PrkcdP28867 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PrkcdP28867 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PrkcdP28867 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
PrkcdP28867 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PrkcdP28867 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
PrkcdP28867 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
PrkcdP28867 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
PrkcdP28867 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
PrkcdP28867 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PrkcdP28867 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PrkcdP28867 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PrkcdP28867 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PrkcdP28867 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PrkcdP28867 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PrkcdP28867 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
PrkcdP28867 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PrkcdP28867 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PrkcdP28867 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PrkcdP28867 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PrkcdP28867 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PrkcdP28867 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PrkcdP28867 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PrkcdP28867 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PrkcdP28867 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PrkcdP28867 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PrkcdP28867 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PrkcdP28867 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PrkcdP28867 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PrkcdP28867 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PrkcdP28867 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
PrkcdP28867 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
PrkcdP28867 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PrkcdP28867 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PrkcdP28867 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PrkcdP28867 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PrkcdP28867 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PrkcdP28867 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PrkcdP28867 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PrkcdP28867 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PrkcdP28867 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PrkcdP28867 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PrkcdP28867 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PrkcdP28867 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PrkcdP28867 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
PrkcdP28867 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PrkcdP28867 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PrkcdP28867 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PrkcdP28867 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
PrkcdP28867 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PrkcdP28867 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PrkcdP28867 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PrkcdP28867 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
PrkcdP28867 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PrkcdP28867 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PrkcdP28867 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PrkcdP28867 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PrkcdP28867 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PrkcdP28867 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PrkcdP28867 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PrkcdP28867 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PrkcdP28867 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PrkcdP28867 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PrkcdP28867 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PrkcdP28867 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PrkcdP28867 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PrkcdP28867 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PrkcdP28867 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
PrkcdP28867 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PrkcdP28867 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PrkcdP28867 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
PrkcdP28867 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PrkcdP28867 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PrkcdP28867 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
PrkcdP28867 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PrkcdP28867 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PrkcdP28867 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PrkcdP28867 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PrkcdP28867 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PrkcdP28867 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PrkcdP28867 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PrkcdP28867 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
PrkcdP28867 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PrkcdP28867 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PrkcdP28867 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PrkcdP28867 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PrkcdP28867 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PrkcdP28867 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
PrkcdP28867 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PrkcdP28867 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 454.1 ms