Protein–RNA interactions for Protein: P28661

Sept4, Septin-4, mousemouse

Predictions only

Length 478 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sept4P28661 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Sept4P28661 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Sept4P28661 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Sept4P28661 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Sept4P28661 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Sept4P28661 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Sept4P28661 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Sept4P28661 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Sept4P28661 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Sept4P28661 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Sept4P28661 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Sept4P28661 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Sept4P28661 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Sept4P28661 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Sept4P28661 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Sept4P28661 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Sept4P28661 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Sept4P28661 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Sept4P28661 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Sept4P28661 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Sept4P28661 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
Sept4P28661 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Sept4P28661 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Sept4P28661 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Sept4P28661 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Sept4P28661 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Sept4P28661 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Sept4P28661 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Sept4P28661 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Sept4P28661 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Sept4P28661 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Sept4P28661 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Sept4P28661 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Sept4P28661 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Sept4P28661 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Sept4P28661 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Sept4P28661 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Sept4P28661 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Sept4P28661 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Sept4P28661 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Sept4P28661 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Sept4P28661 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Sept4P28661 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Sept4P28661 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Sept4P28661 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
Sept4P28661 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Sept4P28661 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Sept4P28661 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Sept4P28661 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
Sept4P28661 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Sept4P28661 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Sept4P28661 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
Sept4P28661 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Sept4P28661 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
Sept4P28661 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Sept4P28661 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Sept4P28661 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Sept4P28661 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Sept4P28661 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Sept4P28661 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Sept4P28661 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Sept4P28661 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Sept4P28661 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Sept4P28661 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Sept4P28661 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Sept4P28661 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Sept4P28661 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Sept4P28661 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Sept4P28661 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
Sept4P28661 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Sept4P28661 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Sept4P28661 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Sept4P28661 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
Sept4P28661 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
Sept4P28661 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Sept4P28661 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Sept4P28661 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Sept4P28661 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Sept4P28661 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Sept4P28661 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Sept4P28661 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Sept4P28661 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Sept4P28661 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Sept4P28661 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Sept4P28661 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Sept4P28661 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Sept4P28661 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Sept4P28661 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Sept4P28661 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Sept4P28661 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Sept4P28661 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Sept4P28661 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Sept4P28661 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Sept4P28661 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Sept4P28661 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Sept4P28661 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
Sept4P28661 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Sept4P28661 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Sept4P28661 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Sept4P28661 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.9 ms