Protein–RNA interactions for Protein: P28571

Slc6a9, Sodium- and chloride-dependent glycine transporter 1, mousemouse

Predictions only

Length 692 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc6a9P28571 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Slc6a9P28571 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Slc6a9P28571 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Slc6a9P28571 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Slc6a9P28571 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Slc6a9P28571 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Slc6a9P28571 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Slc6a9P28571 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Slc6a9P28571 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Slc6a9P28571 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Slc6a9P28571 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Slc6a9P28571 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Slc6a9P28571 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Slc6a9P28571 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Slc6a9P28571 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Slc6a9P28571 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Slc6a9P28571 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Slc6a9P28571 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Slc6a9P28571 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Slc6a9P28571 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Slc6a9P28571 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Slc6a9P28571 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Slc6a9P28571 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Slc6a9P28571 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Slc6a9P28571 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Slc6a9P28571 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Slc6a9P28571 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Slc6a9P28571 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Slc6a9P28571 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Slc6a9P28571 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Slc6a9P28571 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Slc6a9P28571 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Slc6a9P28571 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Slc6a9P28571 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Slc6a9P28571 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Slc6a9P28571 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Slc6a9P28571 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Slc6a9P28571 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Slc6a9P28571 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Slc6a9P28571 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Slc6a9P28571 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Slc6a9P28571 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Slc6a9P28571 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Slc6a9P28571 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Slc6a9P28571 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Slc6a9P28571 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Slc6a9P28571 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Slc6a9P28571 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Slc6a9P28571 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Slc6a9P28571 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Slc6a9P28571 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Slc6a9P28571 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Slc6a9P28571 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Slc6a9P28571 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Slc6a9P28571 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Slc6a9P28571 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Slc6a9P28571 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Slc6a9P28571 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Slc6a9P28571 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Slc6a9P28571 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Slc6a9P28571 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Slc6a9P28571 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Slc6a9P28571 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Slc6a9P28571 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Slc6a9P28571 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Slc6a9P28571 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Slc6a9P28571 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Slc6a9P28571 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Slc6a9P28571 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Slc6a9P28571 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Slc6a9P28571 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Slc6a9P28571 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Slc6a9P28571 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Slc6a9P28571 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Slc6a9P28571 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Slc6a9P28571 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Slc6a9P28571 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Slc6a9P28571 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Slc6a9P28571 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Slc6a9P28571 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Slc6a9P28571 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Slc6a9P28571 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Slc6a9P28571 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Slc6a9P28571 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Slc6a9P28571 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Slc6a9P28571 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Slc6a9P28571 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Slc6a9P28571 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Slc6a9P28571 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Slc6a9P28571 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Slc6a9P28571 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Slc6a9P28571 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Slc6a9P28571 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
Slc6a9P28571 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Slc6a9P28571 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Slc6a9P28571 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Slc6a9P28571 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Slc6a9P28571 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Slc6a9P28571 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Slc6a9P28571 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 89.2 ms