Protein–RNA interactions for Protein: P28309

Defa2, Alpha-defensin 2, mousemouse

Predictions only

Length 93 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa2P28309 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Defa2P28309 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Defa2P28309 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Defa2P28309 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Defa2P28309 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Defa2P28309 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Defa2P28309 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Defa2P28309 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Defa2P28309 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Defa2P28309 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Defa2P28309 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Defa2P28309 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Defa2P28309 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Defa2P28309 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Defa2P28309 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Defa2P28309 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Defa2P28309 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Defa2P28309 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Defa2P28309 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Defa2P28309 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Defa2P28309 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Defa2P28309 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Defa2P28309 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Defa2P28309 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Defa2P28309 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Defa2P28309 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Defa2P28309 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Defa2P28309 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Defa2P28309 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Defa2P28309 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Defa2P28309 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Defa2P28309 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Defa2P28309 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Defa2P28309 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Defa2P28309 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Defa2P28309 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Defa2P28309 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Defa2P28309 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Defa2P28309 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Defa2P28309 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Defa2P28309 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Defa2P28309 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Defa2P28309 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Defa2P28309 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Defa2P28309 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Defa2P28309 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Defa2P28309 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Defa2P28309 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Defa2P28309 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Defa2P28309 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Defa2P28309 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Defa2P28309 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Defa2P28309 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Defa2P28309 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Defa2P28309 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Defa2P28309 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Defa2P28309 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Defa2P28309 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Defa2P28309 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Defa2P28309 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Defa2P28309 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Defa2P28309 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Defa2P28309 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Defa2P28309 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Defa2P28309 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Defa2P28309 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Defa2P28309 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Defa2P28309 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Defa2P28309 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Defa2P28309 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Defa2P28309 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Defa2P28309 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Defa2P28309 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Defa2P28309 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Defa2P28309 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Defa2P28309 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Defa2P28309 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Defa2P28309 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Defa2P28309 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Defa2P28309 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Defa2P28309 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Defa2P28309 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Defa2P28309 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Defa2P28309 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Defa2P28309 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Defa2P28309 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Defa2P28309 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Defa2P28309 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Defa2P28309 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Defa2P28309 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Defa2P28309 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Defa2P28309 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Defa2P28309 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Defa2P28309 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Defa2P28309 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Defa2P28309 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Defa2P28309 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Defa2P28309 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Defa2P28309 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Defa2P28309 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.9 ms