Protein–RNA interactions for Protein: P23813

Hoxd11, Homeobox protein Hox-D11, mousemouse

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Length 323 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd11P23813 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Hoxd11P23813 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Hoxd11P23813 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Hoxd11P23813 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Hoxd11P23813 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Hoxd11P23813 Gm4131-201ENSMUST00000186010 1264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Hoxd11P23813 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Hoxd11P23813 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Hoxd11P23813 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Hoxd11P23813 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Hoxd11P23813 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Hoxd11P23813 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Hoxd11P23813 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Hoxd11P23813 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Hoxd11P23813 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Hoxd11P23813 Gm37436-201ENSMUST00000193842 1085 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
Hoxd11P23813 Gm39317-201ENSMUST00000213360 1138 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Hoxd11P23813 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC26■■□□□ 1.75
Hoxd11P23813 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Hoxd11P23813 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Hoxd11P23813 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Hoxd11P23813 Gm45484-201ENSMUST00000210310 1141 ntBASIC26■■□□□ 1.75
Hoxd11P23813 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Hoxd11P23813 Gemin6-201ENSMUST00000069486 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Hoxd11P23813 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Hoxd11P23813 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Hoxd11P23813 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Hoxd11P23813 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Hoxd11P23813 2810403D21Rik-207ENSMUST00000152089 852 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Hoxd11P23813 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
Hoxd11P23813 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
Hoxd11P23813 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Hoxd11P23813 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Hoxd11P23813 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Hoxd11P23813 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Hoxd11P23813 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Hoxd11P23813 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
Hoxd11P23813 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Hoxd11P23813 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Hoxd11P23813 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Hoxd11P23813 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Hoxd11P23813 Gm29107-201ENSMUST00000190910 347 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
Hoxd11P23813 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Hoxd11P23813 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Hoxd11P23813 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Hoxd11P23813 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
Hoxd11P23813 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Hoxd11P23813 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Hoxd11P23813 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Hoxd11P23813 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Hoxd11P23813 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
Hoxd11P23813 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Hoxd11P23813 Gm12439-201ENSMUST00000117162 365 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
Hoxd11P23813 Gm25318-201ENSMUST00000122554 314 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
Hoxd11P23813 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Hoxd11P23813 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Hoxd11P23813 Gm10271-201ENSMUST00000092165 156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Hoxd11P23813 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
Hoxd11P23813 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Hoxd11P23813 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Hoxd11P23813 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Hoxd11P23813 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Hoxd11P23813 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Hoxd11P23813 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
Hoxd11P23813 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Hoxd11P23813 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Hoxd11P23813 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Hoxd11P23813 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Hoxd11P23813 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Hoxd11P23813 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Hoxd11P23813 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Hoxd11P23813 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Hoxd11P23813 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
Hoxd11P23813 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Hoxd11P23813 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Hoxd11P23813 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Hoxd11P23813 Olfr1233-201ENSMUST00000099784 1042 ntAPPRIS P1 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Hoxd11P23813 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Hoxd11P23813 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Hoxd11P23813 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Hoxd11P23813 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
Hoxd11P23813 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Hoxd11P23813 Gm6991-201ENSMUST00000218475 1178 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
Hoxd11P23813 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Hoxd11P23813 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Hoxd11P23813 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Hoxd11P23813 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Hoxd11P23813 Vmn1r-ps144-201ENSMUST00000177291 939 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
Hoxd11P23813 Cnot2-201ENSMUST00000020374 1059 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Hoxd11P23813 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Hoxd11P23813 AC154828.2-201ENSMUST00000220908 1070 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
Hoxd11P23813 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Hoxd11P23813 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Hoxd11P23813 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Hoxd11P23813 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
Hoxd11P23813 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Hoxd11P23813 Gm20822-202ENSMUST00000188422 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Hoxd11P23813 Gm20828-202ENSMUST00000190516 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Hoxd11P23813 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
Hoxd11P23813 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
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