Protein–RNA interactions for Protein: P23738

Hdc, Histidine decarboxylase, mousemouse

Predictions only

Length 662 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HdcP23738 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
HdcP23738 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
HdcP23738 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
HdcP23738 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
HdcP23738 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
HdcP23738 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
HdcP23738 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
HdcP23738 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
HdcP23738 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
HdcP23738 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
HdcP23738 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
HdcP23738 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
HdcP23738 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
HdcP23738 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
HdcP23738 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
HdcP23738 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
HdcP23738 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
HdcP23738 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
HdcP23738 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
HdcP23738 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
HdcP23738 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
HdcP23738 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
HdcP23738 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
HdcP23738 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
HdcP23738 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
HdcP23738 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
HdcP23738 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
HdcP23738 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
HdcP23738 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
HdcP23738 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
HdcP23738 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
HdcP23738 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
HdcP23738 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
HdcP23738 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
HdcP23738 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
HdcP23738 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
HdcP23738 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
HdcP23738 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
HdcP23738 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
HdcP23738 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
HdcP23738 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
HdcP23738 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
HdcP23738 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
HdcP23738 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
HdcP23738 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
HdcP23738 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
HdcP23738 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
HdcP23738 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
HdcP23738 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
HdcP23738 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
HdcP23738 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
HdcP23738 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
HdcP23738 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
HdcP23738 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
HdcP23738 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
HdcP23738 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
HdcP23738 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
HdcP23738 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
HdcP23738 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
HdcP23738 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
HdcP23738 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
HdcP23738 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
HdcP23738 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
HdcP23738 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
HdcP23738 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
HdcP23738 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
HdcP23738 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
HdcP23738 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
HdcP23738 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
HdcP23738 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
HdcP23738 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
HdcP23738 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
HdcP23738 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
HdcP23738 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
HdcP23738 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
HdcP23738 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
HdcP23738 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
HdcP23738 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
HdcP23738 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
HdcP23738 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
HdcP23738 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
HdcP23738 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
HdcP23738 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
HdcP23738 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
HdcP23738 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
HdcP23738 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
HdcP23738 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
HdcP23738 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
HdcP23738 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
HdcP23738 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
HdcP23738 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
HdcP23738 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
HdcP23738 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
HdcP23738 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
HdcP23738 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
HdcP23738 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
HdcP23738 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
HdcP23738 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
HdcP23738 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
HdcP23738 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.6 ms