Protein–RNA interactions for Protein: P19426

Nelfe, Negative elongation factor E, mousemouse

Predictions only

Length 375 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NelfeP19426 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
NelfeP19426 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
NelfeP19426 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
NelfeP19426 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
NelfeP19426 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
NelfeP19426 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
NelfeP19426 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
NelfeP19426 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
NelfeP19426 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
NelfeP19426 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
NelfeP19426 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
NelfeP19426 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
NelfeP19426 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
NelfeP19426 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
NelfeP19426 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
NelfeP19426 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
NelfeP19426 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
NelfeP19426 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC21.01■□□□□ 0.95
NelfeP19426 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
NelfeP19426 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
NelfeP19426 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
NelfeP19426 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
NelfeP19426 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
NelfeP19426 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
NelfeP19426 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
NelfeP19426 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
NelfeP19426 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
NelfeP19426 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
NelfeP19426 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC21■□□□□ 0.95
NelfeP19426 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
NelfeP19426 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC21■□□□□ 0.95
NelfeP19426 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
NelfeP19426 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
NelfeP19426 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
NelfeP19426 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
NelfeP19426 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
NelfeP19426 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
NelfeP19426 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC20.98■□□□□ 0.95
NelfeP19426 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
NelfeP19426 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
NelfeP19426 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
NelfeP19426 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
NelfeP19426 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
NelfeP19426 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
NelfeP19426 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
NelfeP19426 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
NelfeP19426 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
NelfeP19426 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
NelfeP19426 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC20.96■□□□□ 0.95
NelfeP19426 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
NelfeP19426 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
NelfeP19426 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
NelfeP19426 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
NelfeP19426 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
NelfeP19426 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
NelfeP19426 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
NelfeP19426 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
NelfeP19426 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
NelfeP19426 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
NelfeP19426 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
NelfeP19426 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
NelfeP19426 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
NelfeP19426 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
NelfeP19426 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
NelfeP19426 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
NelfeP19426 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
NelfeP19426 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
NelfeP19426 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
NelfeP19426 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
NelfeP19426 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
NelfeP19426 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
NelfeP19426 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
NelfeP19426 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
NelfeP19426 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
NelfeP19426 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
NelfeP19426 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
NelfeP19426 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
NelfeP19426 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
NelfeP19426 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
NelfeP19426 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
NelfeP19426 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
NelfeP19426 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
NelfeP19426 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
NelfeP19426 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
NelfeP19426 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC20.91■□□□□ 0.94
NelfeP19426 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
NelfeP19426 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC20.9■□□□□ 0.94
NelfeP19426 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
NelfeP19426 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
NelfeP19426 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
NelfeP19426 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
NelfeP19426 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
NelfeP19426 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
NelfeP19426 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
NelfeP19426 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
NelfeP19426 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC20.89■□□□□ 0.93
NelfeP19426 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
NelfeP19426 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
NelfeP19426 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC20.89■□□□□ 0.93
NelfeP19426 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.7 ms