Protein–RNA interactions for Protein: P13705

Msh3, DNA mismatch repair protein Msh3, mousemouse

Predictions only

Length 1,091 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Msh3P13705 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Msh3P13705 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Msh3P13705 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Msh3P13705 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Msh3P13705 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Msh3P13705 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Msh3P13705 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Msh3P13705 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Msh3P13705 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Msh3P13705 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Msh3P13705 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Msh3P13705 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Msh3P13705 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Msh3P13705 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Msh3P13705 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Msh3P13705 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Msh3P13705 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Msh3P13705 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Msh3P13705 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Msh3P13705 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Msh3P13705 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Msh3P13705 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Msh3P13705 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Msh3P13705 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Msh3P13705 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Msh3P13705 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Msh3P13705 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Msh3P13705 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Msh3P13705 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Msh3P13705 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
Msh3P13705 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
Msh3P13705 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Msh3P13705 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Msh3P13705 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Msh3P13705 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Msh3P13705 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Msh3P13705 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Msh3P13705 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Msh3P13705 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Msh3P13705 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Msh3P13705 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Msh3P13705 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Msh3P13705 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Msh3P13705 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Msh3P13705 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Msh3P13705 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
Msh3P13705 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Msh3P13705 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Msh3P13705 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Msh3P13705 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Msh3P13705 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Msh3P13705 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Msh3P13705 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Msh3P13705 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Msh3P13705 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
Msh3P13705 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Msh3P13705 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Msh3P13705 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Msh3P13705 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Msh3P13705 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Msh3P13705 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Msh3P13705 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Msh3P13705 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Msh3P13705 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Msh3P13705 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Msh3P13705 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Msh3P13705 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Msh3P13705 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
Msh3P13705 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Msh3P13705 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Msh3P13705 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Msh3P13705 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Msh3P13705 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Msh3P13705 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Msh3P13705 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
Msh3P13705 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
Msh3P13705 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Msh3P13705 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Msh3P13705 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Msh3P13705 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Msh3P13705 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Msh3P13705 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Msh3P13705 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Msh3P13705 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Msh3P13705 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Msh3P13705 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Msh3P13705 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Msh3P13705 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Msh3P13705 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Msh3P13705 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Msh3P13705 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Msh3P13705 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Msh3P13705 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Msh3P13705 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Msh3P13705 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Msh3P13705 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Msh3P13705 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Msh3P13705 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Msh3P13705 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Msh3P13705 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.5 ms