Protein–RNA interactions for Protein: P13379

Cd5, T-cell surface glycoprotein CD5, mousemouse

Predictions only

Length 494 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd5P13379 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Cd5P13379 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Cd5P13379 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Cd5P13379 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Cd5P13379 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Cd5P13379 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Cd5P13379 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Cd5P13379 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Cd5P13379 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Cd5P13379 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Cd5P13379 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Cd5P13379 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Cd5P13379 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
Cd5P13379 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Cd5P13379 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
Cd5P13379 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Cd5P13379 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Cd5P13379 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Cd5P13379 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Cd5P13379 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Cd5P13379 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Cd5P13379 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Cd5P13379 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Cd5P13379 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Cd5P13379 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Cd5P13379 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Cd5P13379 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Cd5P13379 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Cd5P13379 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Cd5P13379 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Cd5P13379 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Cd5P13379 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Cd5P13379 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Cd5P13379 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Cd5P13379 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Cd5P13379 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Cd5P13379 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Cd5P13379 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Cd5P13379 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cd5P13379 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cd5P13379 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cd5P13379 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Cd5P13379 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cd5P13379 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cd5P13379 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cd5P13379 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cd5P13379 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cd5P13379 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cd5P13379 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cd5P13379 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cd5P13379 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cd5P13379 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cd5P13379 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cd5P13379 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cd5P13379 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cd5P13379 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cd5P13379 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cd5P13379 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cd5P13379 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cd5P13379 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Cd5P13379 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC18.58■□□□□ 0.57
Cd5P13379 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Cd5P13379 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Cd5P13379 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Cd5P13379 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Cd5P13379 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Cd5P13379 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Cd5P13379 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cd5P13379 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cd5P13379 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cd5P13379 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cd5P13379 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cd5P13379 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cd5P13379 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cd5P13379 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cd5P13379 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cd5P13379 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cd5P13379 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cd5P13379 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Cd5P13379 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cd5P13379 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cd5P13379 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cd5P13379 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cd5P13379 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cd5P13379 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cd5P13379 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cd5P13379 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cd5P13379 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cd5P13379 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cd5P13379 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cd5P13379 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cd5P13379 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cd5P13379 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cd5P13379 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cd5P13379 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cd5P13379 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cd5P13379 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cd5P13379 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cd5P13379 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cd5P13379 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 105 ms