Protein–RNA interactions for Protein: P11679

Krt8, Keratin, type II cytoskeletal 8, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 490 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt8P11679 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Krt8P11679 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Krt8P11679 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Krt8P11679 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Krt8P11679 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Krt8P11679 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Krt8P11679 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Krt8P11679 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Krt8P11679 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Krt8P11679 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Krt8P11679 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Krt8P11679 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Krt8P11679 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Krt8P11679 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Krt8P11679 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Krt8P11679 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Krt8P11679 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Krt8P11679 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Krt8P11679 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Krt8P11679 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Krt8P11679 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Krt8P11679 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Krt8P11679 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Krt8P11679 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Krt8P11679 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Krt8P11679 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Krt8P11679 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Krt8P11679 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Krt8P11679 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Krt8P11679 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Krt8P11679 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Krt8P11679 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Krt8P11679 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Krt8P11679 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Krt8P11679 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Krt8P11679 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Krt8P11679 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Krt8P11679 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Krt8P11679 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Krt8P11679 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Krt8P11679 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Krt8P11679 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Krt8P11679 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Krt8P11679 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Krt8P11679 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Krt8P11679 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Krt8P11679 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Krt8P11679 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Krt8P11679 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Krt8P11679 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Krt8P11679 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Krt8P11679 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Krt8P11679 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Krt8P11679 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Krt8P11679 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Krt8P11679 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Krt8P11679 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Krt8P11679 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Krt8P11679 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Krt8P11679 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Krt8P11679 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Krt8P11679 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Krt8P11679 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Krt8P11679 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Krt8P11679 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Krt8P11679 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Krt8P11679 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Krt8P11679 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Krt8P11679 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Krt8P11679 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Krt8P11679 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Krt8P11679 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Krt8P11679 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Krt8P11679 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Krt8P11679 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Krt8P11679 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Krt8P11679 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.15
Krt8P11679 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Krt8P11679 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Krt8P11679 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Krt8P11679 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Krt8P11679 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Krt8P11679 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Krt8P11679 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Krt8P11679 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Krt8P11679 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Krt8P11679 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Krt8P11679 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Krt8P11679 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Krt8P11679 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Krt8P11679 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Krt8P11679 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Krt8P11679 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Krt8P11679 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Krt8P11679 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Krt8P11679 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Krt8P11679 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Krt8P11679 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Krt8P11679 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Krt8P11679 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.1 ms