Protein–RNA interactions for Protein: P11403

Fgf4, Fibroblast growth factor 4, mousemouse

Predictions only

Length 202 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fgf4P11403 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Fgf4P11403 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Fgf4P11403 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Fgf4P11403 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Fgf4P11403 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Fgf4P11403 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Fgf4P11403 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Fgf4P11403 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Fgf4P11403 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Fgf4P11403 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Fgf4P11403 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Fgf4P11403 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Fgf4P11403 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Fgf4P11403 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Fgf4P11403 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Fgf4P11403 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Fgf4P11403 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Fgf4P11403 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Fgf4P11403 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Fgf4P11403 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Fgf4P11403 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Fgf4P11403 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Fgf4P11403 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Fgf4P11403 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Fgf4P11403 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Fgf4P11403 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Fgf4P11403 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Fgf4P11403 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Fgf4P11403 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Fgf4P11403 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Fgf4P11403 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Fgf4P11403 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Fgf4P11403 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Fgf4P11403 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Fgf4P11403 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Fgf4P11403 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Fgf4P11403 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Fgf4P11403 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Fgf4P11403 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Fgf4P11403 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Fgf4P11403 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Fgf4P11403 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Fgf4P11403 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Fgf4P11403 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Fgf4P11403 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Fgf4P11403 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Fgf4P11403 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Fgf4P11403 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Fgf4P11403 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Fgf4P11403 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Fgf4P11403 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Fgf4P11403 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Fgf4P11403 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Fgf4P11403 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Fgf4P11403 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Fgf4P11403 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Fgf4P11403 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Fgf4P11403 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Fgf4P11403 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Fgf4P11403 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Fgf4P11403 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Fgf4P11403 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Fgf4P11403 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Fgf4P11403 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Fgf4P11403 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Fgf4P11403 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Fgf4P11403 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Fgf4P11403 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Fgf4P11403 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Fgf4P11403 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Fgf4P11403 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Fgf4P11403 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Fgf4P11403 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Fgf4P11403 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Fgf4P11403 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Fgf4P11403 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Fgf4P11403 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Fgf4P11403 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Fgf4P11403 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Fgf4P11403 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Fgf4P11403 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Fgf4P11403 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Fgf4P11403 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Fgf4P11403 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Fgf4P11403 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Fgf4P11403 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Fgf4P11403 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Fgf4P11403 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Fgf4P11403 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Fgf4P11403 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Fgf4P11403 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Fgf4P11403 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Fgf4P11403 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Fgf4P11403 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Fgf4P11403 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Fgf4P11403 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Fgf4P11403 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Fgf4P11403 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Fgf4P11403 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Fgf4P11403 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.4 ms