Protein–RNA interactions for Protein: P11087

Col1a1, Collagen alpha-1(I) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,453 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col1a1P11087 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Col1a1P11087 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Col1a1P11087 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Col1a1P11087 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Col1a1P11087 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Col1a1P11087 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Col1a1P11087 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
Col1a1P11087 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Col1a1P11087 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Col1a1P11087 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Col1a1P11087 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Col1a1P11087 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Col1a1P11087 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Col1a1P11087 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Col1a1P11087 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Col1a1P11087 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Col1a1P11087 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Col1a1P11087 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Col1a1P11087 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Col1a1P11087 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
Col1a1P11087 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Col1a1P11087 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Col1a1P11087 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Col1a1P11087 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
Col1a1P11087 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Col1a1P11087 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Col1a1P11087 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Col1a1P11087 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Col1a1P11087 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Col1a1P11087 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Col1a1P11087 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Col1a1P11087 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Col1a1P11087 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Col1a1P11087 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Col1a1P11087 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Col1a1P11087 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Col1a1P11087 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Col1a1P11087 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Col1a1P11087 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Col1a1P11087 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Col1a1P11087 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Col1a1P11087 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
Col1a1P11087 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Col1a1P11087 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Col1a1P11087 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Col1a1P11087 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Col1a1P11087 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Col1a1P11087 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Col1a1P11087 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Col1a1P11087 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Col1a1P11087 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Col1a1P11087 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Col1a1P11087 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Col1a1P11087 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Col1a1P11087 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
Col1a1P11087 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Col1a1P11087 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Col1a1P11087 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Col1a1P11087 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Col1a1P11087 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Col1a1P11087 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
Col1a1P11087 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
Col1a1P11087 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Col1a1P11087 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC26■■□□□ 1.75
Col1a1P11087 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Col1a1P11087 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
Col1a1P11087 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Col1a1P11087 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Col1a1P11087 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Col1a1P11087 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Col1a1P11087 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Col1a1P11087 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Col1a1P11087 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
Col1a1P11087 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Col1a1P11087 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Col1a1P11087 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Col1a1P11087 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Col1a1P11087 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
Col1a1P11087 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Col1a1P11087 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Col1a1P11087 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
Col1a1P11087 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
Col1a1P11087 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Col1a1P11087 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Col1a1P11087 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Col1a1P11087 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Col1a1P11087 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Col1a1P11087 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Col1a1P11087 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Col1a1P11087 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
Col1a1P11087 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Col1a1P11087 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Col1a1P11087 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Col1a1P11087 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Col1a1P11087 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Col1a1P11087 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Col1a1P11087 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Col1a1P11087 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Col1a1P11087 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Col1a1P11087 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.9 ms