Protein–RNA interactions for Protein: P10923

Spp1, Osteopontin, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 294 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spp1P10923 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Spp1P10923 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Spp1P10923 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Spp1P10923 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Spp1P10923 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Spp1P10923 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Spp1P10923 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Spp1P10923 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Spp1P10923 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Spp1P10923 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Spp1P10923 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Spp1P10923 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Spp1P10923 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Spp1P10923 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Spp1P10923 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Spp1P10923 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Spp1P10923 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Spp1P10923 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Spp1P10923 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Spp1P10923 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Spp1P10923 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Spp1P10923 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Spp1P10923 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Spp1P10923 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Spp1P10923 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Spp1P10923 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Spp1P10923 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Spp1P10923 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Spp1P10923 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Spp1P10923 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Spp1P10923 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Spp1P10923 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Spp1P10923 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Spp1P10923 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Spp1P10923 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Spp1P10923 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Spp1P10923 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Spp1P10923 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Spp1P10923 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Spp1P10923 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Spp1P10923 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Spp1P10923 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Spp1P10923 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Spp1P10923 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Spp1P10923 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Spp1P10923 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Spp1P10923 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Spp1P10923 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Spp1P10923 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Spp1P10923 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Spp1P10923 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Spp1P10923 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Spp1P10923 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Spp1P10923 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Spp1P10923 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Spp1P10923 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Spp1P10923 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Spp1P10923 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Spp1P10923 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Spp1P10923 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Spp1P10923 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Spp1P10923 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Spp1P10923 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Spp1P10923 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Spp1P10923 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Spp1P10923 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Spp1P10923 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Spp1P10923 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Spp1P10923 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Spp1P10923 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Spp1P10923 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Spp1P10923 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Spp1P10923 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Spp1P10923 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Spp1P10923 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Spp1P10923 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Spp1P10923 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Spp1P10923 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Spp1P10923 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Spp1P10923 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Spp1P10923 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Spp1P10923 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Spp1P10923 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Spp1P10923 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Spp1P10923 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Spp1P10923 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Spp1P10923 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Spp1P10923 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Spp1P10923 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Spp1P10923 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Spp1P10923 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Spp1P10923 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Spp1P10923 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Spp1P10923 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
Spp1P10923 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Spp1P10923 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Spp1P10923 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Spp1P10923 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Spp1P10923 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Spp1P10923 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.2 ms