Protein–RNA interactions for Protein: P09026

Hoxb3, Homeobox protein Hox-B3, mousemouse

Predictions only

Length 433 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxb3P09026 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Hoxb3P09026 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Hoxb3P09026 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Hoxb3P09026 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Hoxb3P09026 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Hoxb3P09026 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Hoxb3P09026 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Hoxb3P09026 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Hoxb3P09026 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Hoxb3P09026 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Hoxb3P09026 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Hoxb3P09026 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Hoxb3P09026 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Hoxb3P09026 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Hoxb3P09026 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Hoxb3P09026 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Hoxb3P09026 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Hoxb3P09026 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Hoxb3P09026 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Hoxb3P09026 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Hoxb3P09026 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Hoxb3P09026 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Hoxb3P09026 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Hoxb3P09026 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Hoxb3P09026 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Hoxb3P09026 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Hoxb3P09026 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Hoxb3P09026 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Hoxb3P09026 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Hoxb3P09026 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Hoxb3P09026 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Hoxb3P09026 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Hoxb3P09026 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Hoxb3P09026 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Hoxb3P09026 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Hoxb3P09026 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Hoxb3P09026 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Hoxb3P09026 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Hoxb3P09026 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Hoxb3P09026 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Hoxb3P09026 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Hoxb3P09026 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Hoxb3P09026 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Hoxb3P09026 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Hoxb3P09026 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Hoxb3P09026 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Hoxb3P09026 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Hoxb3P09026 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Hoxb3P09026 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Hoxb3P09026 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Hoxb3P09026 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Hoxb3P09026 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Hoxb3P09026 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Hoxb3P09026 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Hoxb3P09026 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Hoxb3P09026 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Hoxb3P09026 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Hoxb3P09026 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Hoxb3P09026 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Hoxb3P09026 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Hoxb3P09026 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.07
Hoxb3P09026 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
Hoxb3P09026 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Hoxb3P09026 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Hoxb3P09026 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Hoxb3P09026 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Hoxb3P09026 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Hoxb3P09026 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Hoxb3P09026 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Hoxb3P09026 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Hoxb3P09026 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Hoxb3P09026 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Hoxb3P09026 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Hoxb3P09026 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Hoxb3P09026 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Hoxb3P09026 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Hoxb3P09026 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Hoxb3P09026 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Hoxb3P09026 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Hoxb3P09026 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Hoxb3P09026 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Hoxb3P09026 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Hoxb3P09026 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Hoxb3P09026 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Hoxb3P09026 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Hoxb3P09026 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Hoxb3P09026 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Hoxb3P09026 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Hoxb3P09026 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Hoxb3P09026 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Hoxb3P09026 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Hoxb3P09026 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Hoxb3P09026 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Hoxb3P09026 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Hoxb3P09026 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Hoxb3P09026 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Hoxb3P09026 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Hoxb3P09026 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Hoxb3P09026 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Hoxb3P09026 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.3 ms