Protein–RNA interactions for Protein: P09021

Hoxa5, Homeobox protein Hox-A5, mousemouse

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxa5P09021 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Hoxa5P09021 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Hoxa5P09021 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Hoxa5P09021 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Hoxa5P09021 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Hoxa5P09021 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Hoxa5P09021 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Hoxa5P09021 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Hoxa5P09021 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Hoxa5P09021 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Hoxa5P09021 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Hoxa5P09021 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Hoxa5P09021 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Hoxa5P09021 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Hoxa5P09021 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Hoxa5P09021 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Hoxa5P09021 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Hoxa5P09021 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Hoxa5P09021 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Hoxa5P09021 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Hoxa5P09021 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Hoxa5P09021 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Hoxa5P09021 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Hoxa5P09021 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Hoxa5P09021 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Hoxa5P09021 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Hoxa5P09021 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Hoxa5P09021 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Hoxa5P09021 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Hoxa5P09021 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Hoxa5P09021 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Hoxa5P09021 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Hoxa5P09021 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Hoxa5P09021 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Hoxa5P09021 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Hoxa5P09021 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Hoxa5P09021 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Hoxa5P09021 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Hoxa5P09021 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Hoxa5P09021 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Hoxa5P09021 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Hoxa5P09021 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Hoxa5P09021 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Hoxa5P09021 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Hoxa5P09021 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Hoxa5P09021 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Hoxa5P09021 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Hoxa5P09021 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Hoxa5P09021 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Hoxa5P09021 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Hoxa5P09021 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Hoxa5P09021 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Hoxa5P09021 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Hoxa5P09021 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Hoxa5P09021 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Hoxa5P09021 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Hoxa5P09021 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Hoxa5P09021 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Hoxa5P09021 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Hoxa5P09021 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Hoxa5P09021 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Hoxa5P09021 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Hoxa5P09021 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Hoxa5P09021 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Hoxa5P09021 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Hoxa5P09021 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Hoxa5P09021 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Hoxa5P09021 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Hoxa5P09021 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Hoxa5P09021 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Hoxa5P09021 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Hoxa5P09021 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Hoxa5P09021 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Hoxa5P09021 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Hoxa5P09021 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Hoxa5P09021 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Hoxa5P09021 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Hoxa5P09021 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Hoxa5P09021 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Hoxa5P09021 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Hoxa5P09021 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Hoxa5P09021 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Hoxa5P09021 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Hoxa5P09021 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Hoxa5P09021 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Hoxa5P09021 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Hoxa5P09021 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Hoxa5P09021 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Hoxa5P09021 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Hoxa5P09021 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Hoxa5P09021 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Hoxa5P09021 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Hoxa5P09021 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Hoxa5P09021 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Hoxa5P09021 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Hoxa5P09021 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Hoxa5P09021 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Hoxa5P09021 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Hoxa5P09021 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Hoxa5P09021 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 100.3 ms