Protein–RNA interactions for Protein: P08551

Nefl, Neurofilament light polypeptide, mousemouse

Predictions only

Length 543 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NeflP08551 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
NeflP08551 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
NeflP08551 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
NeflP08551 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
NeflP08551 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
NeflP08551 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
NeflP08551 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
NeflP08551 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
NeflP08551 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC28.16■■■□□ 2.1
NeflP08551 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
NeflP08551 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
NeflP08551 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
NeflP08551 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
NeflP08551 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
NeflP08551 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
NeflP08551 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.09
NeflP08551 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.09
NeflP08551 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
NeflP08551 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
NeflP08551 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
NeflP08551 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
NeflP08551 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
NeflP08551 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
NeflP08551 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
NeflP08551 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
NeflP08551 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
NeflP08551 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
NeflP08551 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC28.12■■■□□ 2.09
NeflP08551 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
NeflP08551 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
NeflP08551 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
NeflP08551 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
NeflP08551 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
NeflP08551 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
NeflP08551 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
NeflP08551 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
NeflP08551 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC28.1■■■□□ 2.09
NeflP08551 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
NeflP08551 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
NeflP08551 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
NeflP08551 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
NeflP08551 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
NeflP08551 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
NeflP08551 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
NeflP08551 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC28.09■■■□□ 2.09
NeflP08551 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
NeflP08551 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
NeflP08551 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
NeflP08551 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
NeflP08551 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
NeflP08551 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
NeflP08551 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
NeflP08551 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
NeflP08551 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
NeflP08551 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
NeflP08551 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
NeflP08551 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
NeflP08551 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
NeflP08551 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
NeflP08551 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
NeflP08551 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
NeflP08551 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
NeflP08551 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
NeflP08551 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
NeflP08551 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
NeflP08551 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
NeflP08551 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
NeflP08551 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
NeflP08551 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
NeflP08551 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
NeflP08551 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
NeflP08551 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
NeflP08551 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
NeflP08551 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
NeflP08551 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
NeflP08551 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
NeflP08551 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
NeflP08551 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
NeflP08551 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
NeflP08551 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
NeflP08551 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC28.01■■■□□ 2.07
NeflP08551 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
NeflP08551 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
NeflP08551 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
NeflP08551 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
NeflP08551 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC28■■■□□ 2.07
NeflP08551 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
NeflP08551 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
NeflP08551 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
NeflP08551 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
NeflP08551 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
NeflP08551 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
NeflP08551 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
NeflP08551 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
NeflP08551 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
NeflP08551 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
NeflP08551 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC27.98■■■□□ 2.07
NeflP08551 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
NeflP08551 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
NeflP08551 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.7 ms