Protein–RNA interactions for Protein: P04342

Crygd, Gamma-crystallin D, mousemouse

Predictions only

Length 174 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CrygdP04342 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CrygdP04342 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CrygdP04342 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
CrygdP04342 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CrygdP04342 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CrygdP04342 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CrygdP04342 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CrygdP04342 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CrygdP04342 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CrygdP04342 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CrygdP04342 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
CrygdP04342 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
CrygdP04342 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CrygdP04342 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
CrygdP04342 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CrygdP04342 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CrygdP04342 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CrygdP04342 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
CrygdP04342 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CrygdP04342 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CrygdP04342 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CrygdP04342 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CrygdP04342 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CrygdP04342 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CrygdP04342 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CrygdP04342 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
CrygdP04342 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CrygdP04342 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CrygdP04342 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CrygdP04342 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CrygdP04342 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CrygdP04342 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CrygdP04342 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CrygdP04342 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CrygdP04342 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CrygdP04342 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CrygdP04342 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CrygdP04342 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CrygdP04342 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CrygdP04342 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CrygdP04342 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CrygdP04342 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CrygdP04342 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
CrygdP04342 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CrygdP04342 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CrygdP04342 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CrygdP04342 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CrygdP04342 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CrygdP04342 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CrygdP04342 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CrygdP04342 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CrygdP04342 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CrygdP04342 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CrygdP04342 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CrygdP04342 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CrygdP04342 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CrygdP04342 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CrygdP04342 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CrygdP04342 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CrygdP04342 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CrygdP04342 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CrygdP04342 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CrygdP04342 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CrygdP04342 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CrygdP04342 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CrygdP04342 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CrygdP04342 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CrygdP04342 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CrygdP04342 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CrygdP04342 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CrygdP04342 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CrygdP04342 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CrygdP04342 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CrygdP04342 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
CrygdP04342 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CrygdP04342 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC16■□□□□ 0.15
CrygdP04342 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CrygdP04342 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CrygdP04342 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CrygdP04342 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CrygdP04342 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CrygdP04342 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CrygdP04342 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CrygdP04342 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CrygdP04342 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CrygdP04342 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CrygdP04342 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CrygdP04342 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CrygdP04342 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CrygdP04342 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CrygdP04342 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CrygdP04342 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CrygdP04342 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CrygdP04342 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CrygdP04342 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CrygdP04342 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CrygdP04342 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CrygdP04342 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CrygdP04342 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CrygdP04342 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.4 ms