Protein–RNA interactions for Protein: P01573

Ifna2, Interferon alpha-2, mousemouse

Predictions only

Length 190 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ifna2P01573 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Ifna2P01573 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ifna2P01573 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ifna2P01573 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ifna2P01573 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ifna2P01573 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ifna2P01573 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ifna2P01573 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ifna2P01573 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ifna2P01573 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ifna2P01573 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ifna2P01573 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ifna2P01573 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ifna2P01573 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Ifna2P01573 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Ifna2P01573 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ifna2P01573 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ifna2P01573 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ifna2P01573 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ifna2P01573 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ifna2P01573 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ifna2P01573 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ifna2P01573 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ifna2P01573 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ifna2P01573 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ifna2P01573 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ifna2P01573 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ifna2P01573 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ifna2P01573 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ifna2P01573 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ifna2P01573 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ifna2P01573 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ifna2P01573 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ifna2P01573 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
Ifna2P01573 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ifna2P01573 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Ifna2P01573 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ifna2P01573 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ifna2P01573 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ifna2P01573 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ifna2P01573 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
Ifna2P01573 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ifna2P01573 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ifna2P01573 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ifna2P01573 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ifna2P01573 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ifna2P01573 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Ifna2P01573 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ifna2P01573 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ifna2P01573 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ifna2P01573 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ifna2P01573 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ifna2P01573 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ifna2P01573 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ifna2P01573 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ifna2P01573 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ifna2P01573 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ifna2P01573 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ifna2P01573 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ifna2P01573 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ifna2P01573 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ifna2P01573 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ifna2P01573 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Ifna2P01573 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ifna2P01573 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ifna2P01573 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ifna2P01573 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ifna2P01573 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ifna2P01573 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ifna2P01573 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ifna2P01573 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ifna2P01573 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ifna2P01573 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ifna2P01573 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ifna2P01573 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ifna2P01573 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ifna2P01573 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ifna2P01573 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ifna2P01573 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Ifna2P01573 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ifna2P01573 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ifna2P01573 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ifna2P01573 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ifna2P01573 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ifna2P01573 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ifna2P01573 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ifna2P01573 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Ifna2P01573 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ifna2P01573 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ifna2P01573 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Ifna2P01573 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ifna2P01573 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ifna2P01573 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ifna2P01573 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ifna2P01573 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ifna2P01573 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ifna2P01573 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ifna2P01573 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ifna2P01573 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ifna2P01573 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.8 ms