Protein–RNA interactions for Protein: P01029

C4b, Complement C4-B, mousemouse

Predictions only

Length 1,738 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C4bP01029 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.52■■■□□ 2
C4bP01029 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
C4bP01029 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC27.52■■■□□ 2
C4bP01029 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
C4bP01029 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
C4bP01029 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
C4bP01029 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC27.51■■□□□ 1.99
C4bP01029 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
C4bP01029 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
C4bP01029 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
C4bP01029 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
C4bP01029 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
C4bP01029 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
C4bP01029 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
C4bP01029 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
C4bP01029 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
C4bP01029 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
C4bP01029 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
C4bP01029 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
C4bP01029 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
C4bP01029 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
C4bP01029 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
C4bP01029 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
C4bP01029 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
C4bP01029 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
C4bP01029 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
C4bP01029 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
C4bP01029 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
C4bP01029 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
C4bP01029 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
C4bP01029 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
C4bP01029 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
C4bP01029 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
C4bP01029 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
C4bP01029 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
C4bP01029 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
C4bP01029 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
C4bP01029 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC27.46■■□□□ 1.99
C4bP01029 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
C4bP01029 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
C4bP01029 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
C4bP01029 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
C4bP01029 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
C4bP01029 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
C4bP01029 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
C4bP01029 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
C4bP01029 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
C4bP01029 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
C4bP01029 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
C4bP01029 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
C4bP01029 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
C4bP01029 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
C4bP01029 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
C4bP01029 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC27.41■■□□□ 1.98
C4bP01029 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
C4bP01029 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
C4bP01029 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
C4bP01029 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
C4bP01029 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC27.39■■□□□ 1.98
C4bP01029 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
C4bP01029 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
C4bP01029 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
C4bP01029 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
C4bP01029 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
C4bP01029 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
C4bP01029 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
C4bP01029 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
C4bP01029 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
C4bP01029 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
C4bP01029 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
C4bP01029 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
C4bP01029 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
C4bP01029 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
C4bP01029 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
C4bP01029 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
C4bP01029 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
C4bP01029 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
C4bP01029 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
C4bP01029 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC27.34■■□□□ 1.97
C4bP01029 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
C4bP01029 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
C4bP01029 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
C4bP01029 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
C4bP01029 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC27.33■■□□□ 1.97
C4bP01029 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
C4bP01029 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
C4bP01029 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
C4bP01029 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
C4bP01029 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
C4bP01029 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
C4bP01029 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
C4bP01029 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
C4bP01029 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
C4bP01029 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC27.3■■□□□ 1.96
C4bP01029 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
C4bP01029 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC27.3■■□□□ 1.96
C4bP01029 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
C4bP01029 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
C4bP01029 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
C4bP01029 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.3 ms