Protein–RNA interactions for Protein: P00860

Odc1, Ornithine decarboxylase, mousemouse

Predictions only

Length 461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Odc1P00860 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Odc1P00860 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Odc1P00860 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Odc1P00860 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Odc1P00860 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Odc1P00860 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Odc1P00860 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Odc1P00860 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Odc1P00860 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Odc1P00860 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Odc1P00860 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Odc1P00860 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Odc1P00860 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Odc1P00860 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Odc1P00860 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Odc1P00860 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Odc1P00860 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Odc1P00860 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Odc1P00860 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Odc1P00860 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Odc1P00860 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Odc1P00860 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Odc1P00860 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Odc1P00860 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Odc1P00860 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Odc1P00860 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Odc1P00860 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Odc1P00860 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Odc1P00860 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Odc1P00860 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Odc1P00860 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Odc1P00860 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Odc1P00860 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Odc1P00860 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Odc1P00860 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Odc1P00860 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Odc1P00860 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Odc1P00860 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Odc1P00860 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Odc1P00860 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Odc1P00860 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
Odc1P00860 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Odc1P00860 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Odc1P00860 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Odc1P00860 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Odc1P00860 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Odc1P00860 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Odc1P00860 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Odc1P00860 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Odc1P00860 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Odc1P00860 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Odc1P00860 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Odc1P00860 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Odc1P00860 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Odc1P00860 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Odc1P00860 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Odc1P00860 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Odc1P00860 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Odc1P00860 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Odc1P00860 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Odc1P00860 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Odc1P00860 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Odc1P00860 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Odc1P00860 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Odc1P00860 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Odc1P00860 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Odc1P00860 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Odc1P00860 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Odc1P00860 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Odc1P00860 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Odc1P00860 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Odc1P00860 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Odc1P00860 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Odc1P00860 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Odc1P00860 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Odc1P00860 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Odc1P00860 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Odc1P00860 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Odc1P00860 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Odc1P00860 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Odc1P00860 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Odc1P00860 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Odc1P00860 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Odc1P00860 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Odc1P00860 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Odc1P00860 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Odc1P00860 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Odc1P00860 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Odc1P00860 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Odc1P00860 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Odc1P00860 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Odc1P00860 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Odc1P00860 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Odc1P00860 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Odc1P00860 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Odc1P00860 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Odc1P00860 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Odc1P00860 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Odc1P00860 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Odc1P00860 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 83.2 ms