Protein–RNA interactions for Protein: P00520

Abl1, Tyrosine-protein kinase ABL1, mousemouse

Predictions only

Length 1,123 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abl1P00520 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Abl1P00520 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Abl1P00520 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Abl1P00520 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Abl1P00520 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Abl1P00520 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Abl1P00520 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Abl1P00520 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Abl1P00520 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Abl1P00520 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Abl1P00520 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Abl1P00520 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Abl1P00520 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Abl1P00520 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Abl1P00520 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Abl1P00520 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
Abl1P00520 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
Abl1P00520 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Abl1P00520 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Abl1P00520 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Abl1P00520 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Abl1P00520 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Abl1P00520 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Abl1P00520 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Abl1P00520 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Abl1P00520 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Abl1P00520 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Abl1P00520 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Abl1P00520 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Abl1P00520 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
Abl1P00520 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Abl1P00520 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Abl1P00520 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Abl1P00520 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Abl1P00520 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Abl1P00520 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Abl1P00520 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Abl1P00520 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Abl1P00520 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Abl1P00520 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Abl1P00520 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Abl1P00520 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Abl1P00520 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
Abl1P00520 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Abl1P00520 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Abl1P00520 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Abl1P00520 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Abl1P00520 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
Abl1P00520 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Abl1P00520 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Abl1P00520 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Abl1P00520 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Abl1P00520 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Abl1P00520 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Abl1P00520 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Abl1P00520 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Abl1P00520 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Abl1P00520 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
Abl1P00520 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Abl1P00520 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Abl1P00520 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Abl1P00520 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Abl1P00520 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Abl1P00520 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Abl1P00520 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Abl1P00520 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Abl1P00520 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Abl1P00520 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Abl1P00520 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Abl1P00520 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Abl1P00520 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Abl1P00520 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Abl1P00520 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Abl1P00520 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Abl1P00520 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Abl1P00520 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Abl1P00520 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Abl1P00520 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Abl1P00520 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Abl1P00520 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
Abl1P00520 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
Abl1P00520 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Abl1P00520 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Abl1P00520 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
Abl1P00520 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Abl1P00520 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Abl1P00520 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Abl1P00520 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Abl1P00520 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Abl1P00520 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Abl1P00520 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
Abl1P00520 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Abl1P00520 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Abl1P00520 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Abl1P00520 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Abl1P00520 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
Abl1P00520 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Abl1P00520 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Abl1P00520 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Abl1P00520 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 8.9 ms