Protein–RNA interactions for Protein: O89051

Itm2b, Integral membrane protein 2B, mousemouse

Predictions only

Length 266 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itm2bO89051 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Itm2bO89051 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Itm2bO89051 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Itm2bO89051 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Itm2bO89051 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Itm2bO89051 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Itm2bO89051 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Itm2bO89051 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Itm2bO89051 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Itm2bO89051 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Itm2bO89051 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Itm2bO89051 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Itm2bO89051 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Itm2bO89051 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Itm2bO89051 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Itm2bO89051 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Itm2bO89051 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Itm2bO89051 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Itm2bO89051 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Itm2bO89051 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Itm2bO89051 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Itm2bO89051 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Itm2bO89051 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Itm2bO89051 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
Itm2bO89051 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Itm2bO89051 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Itm2bO89051 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Itm2bO89051 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Itm2bO89051 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Itm2bO89051 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Itm2bO89051 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Itm2bO89051 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Itm2bO89051 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Itm2bO89051 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Itm2bO89051 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Itm2bO89051 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Itm2bO89051 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Itm2bO89051 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Itm2bO89051 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Itm2bO89051 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Itm2bO89051 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Itm2bO89051 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Itm2bO89051 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Itm2bO89051 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Itm2bO89051 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Itm2bO89051 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Itm2bO89051 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Itm2bO89051 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Itm2bO89051 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Itm2bO89051 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Itm2bO89051 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Itm2bO89051 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Itm2bO89051 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Itm2bO89051 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Itm2bO89051 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Itm2bO89051 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Itm2bO89051 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Itm2bO89051 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Itm2bO89051 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Itm2bO89051 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Itm2bO89051 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Itm2bO89051 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Itm2bO89051 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Itm2bO89051 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Itm2bO89051 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Itm2bO89051 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Itm2bO89051 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Itm2bO89051 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Itm2bO89051 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Itm2bO89051 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Itm2bO89051 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Itm2bO89051 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Itm2bO89051 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Itm2bO89051 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Itm2bO89051 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Itm2bO89051 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Itm2bO89051 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Itm2bO89051 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Itm2bO89051 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Itm2bO89051 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Itm2bO89051 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Itm2bO89051 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Itm2bO89051 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Itm2bO89051 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Itm2bO89051 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Itm2bO89051 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Itm2bO89051 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Itm2bO89051 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.24
Itm2bO89051 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Itm2bO89051 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Itm2bO89051 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Itm2bO89051 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Itm2bO89051 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Itm2bO89051 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Itm2bO89051 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Itm2bO89051 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Itm2bO89051 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Itm2bO89051 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Itm2bO89051 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Itm2bO89051 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.5 ms