Protein–RNA interactions for Protein: O88968

Tcn2, Transcobalamin-2, mousemouse

Predictions only

Length 430 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tcn2O88968 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Tcn2O88968 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Tcn2O88968 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Tcn2O88968 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Tcn2O88968 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Tcn2O88968 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Tcn2O88968 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Tcn2O88968 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Tcn2O88968 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Tcn2O88968 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Tcn2O88968 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Tcn2O88968 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Tcn2O88968 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Tcn2O88968 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Tcn2O88968 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Tcn2O88968 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Tcn2O88968 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Tcn2O88968 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Tcn2O88968 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Tcn2O88968 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Tcn2O88968 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Tcn2O88968 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Tcn2O88968 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Tcn2O88968 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Tcn2O88968 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Tcn2O88968 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Tcn2O88968 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Tcn2O88968 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Tcn2O88968 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Tcn2O88968 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
Tcn2O88968 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
Tcn2O88968 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
Tcn2O88968 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Tcn2O88968 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Tcn2O88968 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Tcn2O88968 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Tcn2O88968 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Tcn2O88968 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
Tcn2O88968 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Tcn2O88968 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Tcn2O88968 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Tcn2O88968 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Tcn2O88968 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Tcn2O88968 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Tcn2O88968 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Tcn2O88968 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Tcn2O88968 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Tcn2O88968 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Tcn2O88968 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Tcn2O88968 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Tcn2O88968 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Tcn2O88968 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
Tcn2O88968 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Tcn2O88968 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Tcn2O88968 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Tcn2O88968 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Tcn2O88968 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Tcn2O88968 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Tcn2O88968 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Tcn2O88968 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Tcn2O88968 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Tcn2O88968 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Tcn2O88968 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
Tcn2O88968 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Tcn2O88968 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Tcn2O88968 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Tcn2O88968 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Tcn2O88968 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Tcn2O88968 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Tcn2O88968 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Tcn2O88968 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Tcn2O88968 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Tcn2O88968 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Tcn2O88968 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Tcn2O88968 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Tcn2O88968 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Tcn2O88968 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Tcn2O88968 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Tcn2O88968 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Tcn2O88968 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Tcn2O88968 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Tcn2O88968 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Tcn2O88968 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Tcn2O88968 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Tcn2O88968 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Tcn2O88968 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Tcn2O88968 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Tcn2O88968 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Tcn2O88968 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Tcn2O88968 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Tcn2O88968 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Tcn2O88968 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Tcn2O88968 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Tcn2O88968 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Tcn2O88968 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Tcn2O88968 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Tcn2O88968 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Tcn2O88968 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Tcn2O88968 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Tcn2O88968 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.2 ms