Protein–RNA interactions for Protein: O88834

Shd, SH2 domain-containing adapter protein D, mousemouse

Predictions only

Length 343 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ShdO88834 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ShdO88834 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ShdO88834 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ShdO88834 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ShdO88834 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ShdO88834 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ShdO88834 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ShdO88834 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ShdO88834 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ShdO88834 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ShdO88834 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ShdO88834 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ShdO88834 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
ShdO88834 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ShdO88834 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
ShdO88834 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ShdO88834 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ShdO88834 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ShdO88834 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ShdO88834 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ShdO88834 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ShdO88834 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ShdO88834 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ShdO88834 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ShdO88834 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ShdO88834 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ShdO88834 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ShdO88834 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ShdO88834 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ShdO88834 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ShdO88834 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ShdO88834 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ShdO88834 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ShdO88834 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
ShdO88834 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ShdO88834 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
ShdO88834 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ShdO88834 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ShdO88834 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ShdO88834 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ShdO88834 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ShdO88834 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ShdO88834 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ShdO88834 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ShdO88834 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ShdO88834 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ShdO88834 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ShdO88834 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ShdO88834 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
ShdO88834 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ShdO88834 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ShdO88834 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ShdO88834 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ShdO88834 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ShdO88834 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ShdO88834 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ShdO88834 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
ShdO88834 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ShdO88834 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ShdO88834 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ShdO88834 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ShdO88834 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ShdO88834 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ShdO88834 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ShdO88834 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ShdO88834 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ShdO88834 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ShdO88834 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ShdO88834 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ShdO88834 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ShdO88834 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ShdO88834 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ShdO88834 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ShdO88834 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ShdO88834 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ShdO88834 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ShdO88834 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ShdO88834 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ShdO88834 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ShdO88834 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ShdO88834 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ShdO88834 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ShdO88834 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ShdO88834 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ShdO88834 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ShdO88834 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ShdO88834 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ShdO88834 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ShdO88834 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ShdO88834 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ShdO88834 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ShdO88834 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ShdO88834 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ShdO88834 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ShdO88834 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
ShdO88834 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
ShdO88834 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ShdO88834 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ShdO88834 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ShdO88834 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 90.9 ms