Protein–RNA interactions for Protein: O88700

Blm, Bloom syndrome protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,416 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BlmO88700 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC34.06■■■■□ 3.04
BlmO88700 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.06■■■■□ 3.04
BlmO88700 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
BlmO88700 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC34.06■■■■□ 3.04
BlmO88700 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC34.05■■■■□ 3.04
BlmO88700 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
BlmO88700 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
BlmO88700 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
BlmO88700 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
BlmO88700 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
BlmO88700 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
BlmO88700 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
BlmO88700 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC34.04■■■■□ 3.04
BlmO88700 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
BlmO88700 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC34.03■■■■□ 3.04
BlmO88700 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC34.03■■■■□ 3.04
BlmO88700 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.03■■■■□ 3.04
BlmO88700 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
BlmO88700 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC34.02■■■■□ 3.04
BlmO88700 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.04
BlmO88700 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC34.01■■■■□ 3.03
BlmO88700 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
BlmO88700 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
BlmO88700 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
BlmO88700 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
BlmO88700 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
BlmO88700 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
BlmO88700 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC33.98■■■■□ 3.03
BlmO88700 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
BlmO88700 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC33.98■■■■□ 3.03
BlmO88700 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
BlmO88700 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
BlmO88700 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC33.97■■■■□ 3.03
BlmO88700 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
BlmO88700 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
BlmO88700 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
BlmO88700 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
BlmO88700 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
BlmO88700 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
BlmO88700 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.03
BlmO88700 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.03
BlmO88700 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.03
BlmO88700 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC33.95■■■■□ 3.03
BlmO88700 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.02
BlmO88700 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC33.95■■■■□ 3.02
BlmO88700 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.02
BlmO88700 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC33.94■■■■□ 3.02
BlmO88700 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
BlmO88700 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC33.94■■■■□ 3.02
BlmO88700 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC33.94■■■■□ 3.02
BlmO88700 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
BlmO88700 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
BlmO88700 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
BlmO88700 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
BlmO88700 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
BlmO88700 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC33.92■■■■□ 3.02
BlmO88700 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC33.92■■■■□ 3.02
BlmO88700 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
BlmO88700 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
BlmO88700 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
BlmO88700 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
BlmO88700 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
BlmO88700 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
BlmO88700 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
BlmO88700 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC33.9■■■■□ 3.02
BlmO88700 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
BlmO88700 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC33.89■■■■□ 3.02
BlmO88700 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC33.89■■■■□ 3.02
BlmO88700 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC33.89■■■■□ 3.02
BlmO88700 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC33.88■■■■□ 3.01
BlmO88700 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
BlmO88700 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC33.88■■■■□ 3.01
BlmO88700 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
BlmO88700 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
BlmO88700 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
BlmO88700 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
BlmO88700 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC33.86■■■■□ 3.01
BlmO88700 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC33.86■■■■□ 3.01
BlmO88700 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
BlmO88700 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC33.84■■■■□ 3.01
BlmO88700 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
BlmO88700 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
BlmO88700 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
BlmO88700 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC33.84■■■■□ 3.01
BlmO88700 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC33.84■■■■□ 3.01
BlmO88700 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
BlmO88700 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
BlmO88700 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
BlmO88700 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC33.83■■■■□ 3.01
BlmO88700 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
BlmO88700 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
BlmO88700 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC33.82■■■■□ 3
BlmO88700 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3
BlmO88700 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC33.82■■■■□ 3
BlmO88700 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3
BlmO88700 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3
BlmO88700 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.81■■■■□ 3
BlmO88700 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC33.81■■■■□ 3
BlmO88700 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
BlmO88700 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC33.8■■■■□ 3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.3 ms