Protein–RNA interactions for Protein: O88552

Cldn2, Claudin-2, mousemouse

Predictions only

Length 230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn2O88552 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cldn2O88552 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
Cldn2O88552 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Cldn2O88552 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Cldn2O88552 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Cldn2O88552 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Cldn2O88552 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cldn2O88552 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cldn2O88552 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cldn2O88552 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Cldn2O88552 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cldn2O88552 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cldn2O88552 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cldn2O88552 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cldn2O88552 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Cldn2O88552 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cldn2O88552 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cldn2O88552 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cldn2O88552 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cldn2O88552 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cldn2O88552 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cldn2O88552 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cldn2O88552 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cldn2O88552 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cldn2O88552 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Cldn2O88552 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cldn2O88552 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cldn2O88552 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Cldn2O88552 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cldn2O88552 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cldn2O88552 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cldn2O88552 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cldn2O88552 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cldn2O88552 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cldn2O88552 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cldn2O88552 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cldn2O88552 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cldn2O88552 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Cldn2O88552 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Cldn2O88552 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Cldn2O88552 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Cldn2O88552 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Cldn2O88552 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Cldn2O88552 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cldn2O88552 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cldn2O88552 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cldn2O88552 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cldn2O88552 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cldn2O88552 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cldn2O88552 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cldn2O88552 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cldn2O88552 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cldn2O88552 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cldn2O88552 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cldn2O88552 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cldn2O88552 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cldn2O88552 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cldn2O88552 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cldn2O88552 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cldn2O88552 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cldn2O88552 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cldn2O88552 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cldn2O88552 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cldn2O88552 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cldn2O88552 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cldn2O88552 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cldn2O88552 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cldn2O88552 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cldn2O88552 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cldn2O88552 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cldn2O88552 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cldn2O88552 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cldn2O88552 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cldn2O88552 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cldn2O88552 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cldn2O88552 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cldn2O88552 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cldn2O88552 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cldn2O88552 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cldn2O88552 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cldn2O88552 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cldn2O88552 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cldn2O88552 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cldn2O88552 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cldn2O88552 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Cldn2O88552 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cldn2O88552 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Cldn2O88552 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cldn2O88552 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cldn2O88552 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cldn2O88552 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cldn2O88552 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cldn2O88552 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cldn2O88552 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Cldn2O88552 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cldn2O88552 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cldn2O88552 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cldn2O88552 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cldn2O88552 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cldn2O88552 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.2 ms