Protein–RNA interactions for Protein: O88516

Dll3, Delta-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 592 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dll3O88516 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
Dll3O88516 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Dll3O88516 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Dll3O88516 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Dll3O88516 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Dll3O88516 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Dll3O88516 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Dll3O88516 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
Dll3O88516 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Dll3O88516 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Dll3O88516 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Dll3O88516 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Dll3O88516 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Dll3O88516 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Dll3O88516 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Dll3O88516 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Dll3O88516 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
Dll3O88516 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Dll3O88516 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Dll3O88516 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Dll3O88516 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Dll3O88516 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Dll3O88516 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Dll3O88516 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Dll3O88516 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Dll3O88516 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Dll3O88516 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Dll3O88516 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Dll3O88516 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Dll3O88516 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Dll3O88516 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Dll3O88516 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Dll3O88516 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Dll3O88516 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Dll3O88516 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Dll3O88516 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Dll3O88516 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Dll3O88516 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Dll3O88516 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Dll3O88516 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Dll3O88516 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Dll3O88516 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Dll3O88516 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Dll3O88516 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Dll3O88516 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Dll3O88516 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Dll3O88516 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Dll3O88516 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Dll3O88516 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Dll3O88516 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Dll3O88516 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Dll3O88516 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Dll3O88516 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Dll3O88516 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Dll3O88516 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Dll3O88516 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Dll3O88516 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Dll3O88516 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Dll3O88516 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Dll3O88516 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Dll3O88516 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Dll3O88516 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Dll3O88516 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Dll3O88516 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Dll3O88516 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Dll3O88516 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Dll3O88516 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Dll3O88516 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Dll3O88516 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Dll3O88516 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Dll3O88516 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Dll3O88516 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Dll3O88516 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Dll3O88516 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Dll3O88516 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
Dll3O88516 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Dll3O88516 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Dll3O88516 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Dll3O88516 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Dll3O88516 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Dll3O88516 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
Dll3O88516 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Dll3O88516 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Dll3O88516 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Dll3O88516 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Dll3O88516 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Dll3O88516 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Dll3O88516 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Dll3O88516 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.98
Dll3O88516 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Dll3O88516 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Dll3O88516 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Dll3O88516 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Dll3O88516 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Dll3O88516 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Dll3O88516 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Dll3O88516 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Dll3O88516 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Dll3O88516 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Dll3O88516 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 138.6 ms