Protein–RNA interactions for Protein: O88509

Dnmt3b, DNA (cytosine-5)-methyltransferase 3B, mousemouse

Predictions only

Length 859 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dnmt3bO88509 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Dnmt3bO88509 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Dnmt3bO88509 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Dnmt3bO88509 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Dnmt3bO88509 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Dnmt3bO88509 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Dnmt3bO88509 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Dnmt3bO88509 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Dnmt3bO88509 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
Dnmt3bO88509 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Dnmt3bO88509 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Dnmt3bO88509 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Dnmt3bO88509 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Dnmt3bO88509 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Dnmt3bO88509 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Dnmt3bO88509 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
Dnmt3bO88509 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Dnmt3bO88509 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.95
Dnmt3bO88509 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Dnmt3bO88509 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Dnmt3bO88509 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Dnmt3bO88509 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Dnmt3bO88509 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Dnmt3bO88509 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
Dnmt3bO88509 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Dnmt3bO88509 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
Dnmt3bO88509 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Dnmt3bO88509 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Dnmt3bO88509 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Dnmt3bO88509 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Dnmt3bO88509 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Dnmt3bO88509 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Dnmt3bO88509 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
Dnmt3bO88509 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Dnmt3bO88509 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Dnmt3bO88509 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Dnmt3bO88509 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Dnmt3bO88509 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
Dnmt3bO88509 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
Dnmt3bO88509 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Dnmt3bO88509 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Dnmt3bO88509 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Dnmt3bO88509 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Dnmt3bO88509 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Dnmt3bO88509 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Dnmt3bO88509 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Dnmt3bO88509 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Dnmt3bO88509 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Dnmt3bO88509 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Dnmt3bO88509 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Dnmt3bO88509 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Dnmt3bO88509 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Dnmt3bO88509 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Dnmt3bO88509 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Dnmt3bO88509 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Dnmt3bO88509 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Dnmt3bO88509 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Dnmt3bO88509 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Dnmt3bO88509 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Dnmt3bO88509 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Dnmt3bO88509 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
Dnmt3bO88509 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Dnmt3bO88509 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
Dnmt3bO88509 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Dnmt3bO88509 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Dnmt3bO88509 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Dnmt3bO88509 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Dnmt3bO88509 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Dnmt3bO88509 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Dnmt3bO88509 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Dnmt3bO88509 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Dnmt3bO88509 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Dnmt3bO88509 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Dnmt3bO88509 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Dnmt3bO88509 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
Dnmt3bO88509 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Dnmt3bO88509 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Dnmt3bO88509 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Dnmt3bO88509 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Dnmt3bO88509 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Dnmt3bO88509 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Dnmt3bO88509 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Dnmt3bO88509 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Dnmt3bO88509 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Dnmt3bO88509 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Dnmt3bO88509 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Dnmt3bO88509 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Dnmt3bO88509 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Dnmt3bO88509 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
Dnmt3bO88509 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Dnmt3bO88509 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Dnmt3bO88509 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Dnmt3bO88509 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Dnmt3bO88509 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Dnmt3bO88509 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Dnmt3bO88509 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Dnmt3bO88509 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Dnmt3bO88509 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Dnmt3bO88509 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Dnmt3bO88509 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.4 ms