Protein–RNA interactions for Protein: O88307

Sorl1, Sortilin-related receptor, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sorl1O88307 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Sorl1O88307 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Sorl1O88307 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Sorl1O88307 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.29
Sorl1O88307 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Sorl1O88307 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Sorl1O88307 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Sorl1O88307 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Sorl1O88307 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Sorl1O88307 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Sorl1O88307 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Sorl1O88307 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Sorl1O88307 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Sorl1O88307 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Sorl1O88307 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Sorl1O88307 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Sorl1O88307 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Sorl1O88307 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Sorl1O88307 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Sorl1O88307 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Sorl1O88307 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Sorl1O88307 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Sorl1O88307 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Sorl1O88307 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Sorl1O88307 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Sorl1O88307 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Sorl1O88307 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Sorl1O88307 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Sorl1O88307 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Sorl1O88307 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Sorl1O88307 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Sorl1O88307 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Sorl1O88307 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Sorl1O88307 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Sorl1O88307 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Sorl1O88307 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Sorl1O88307 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Sorl1O88307 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Sorl1O88307 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Sorl1O88307 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Sorl1O88307 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Sorl1O88307 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Sorl1O88307 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sorl1O88307 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sorl1O88307 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sorl1O88307 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sorl1O88307 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sorl1O88307 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sorl1O88307 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sorl1O88307 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sorl1O88307 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sorl1O88307 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sorl1O88307 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Sorl1O88307 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Sorl1O88307 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Sorl1O88307 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Sorl1O88307 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Sorl1O88307 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Sorl1O88307 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sorl1O88307 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sorl1O88307 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sorl1O88307 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sorl1O88307 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sorl1O88307 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sorl1O88307 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sorl1O88307 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sorl1O88307 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sorl1O88307 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sorl1O88307 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sorl1O88307 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Sorl1O88307 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Sorl1O88307 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Sorl1O88307 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Sorl1O88307 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Sorl1O88307 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Sorl1O88307 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Sorl1O88307 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Sorl1O88307 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Sorl1O88307 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sorl1O88307 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sorl1O88307 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sorl1O88307 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sorl1O88307 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sorl1O88307 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sorl1O88307 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Sorl1O88307 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sorl1O88307 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sorl1O88307 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sorl1O88307 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sorl1O88307 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sorl1O88307 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sorl1O88307 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sorl1O88307 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sorl1O88307 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sorl1O88307 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sorl1O88307 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sorl1O88307 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sorl1O88307 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sorl1O88307 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Sorl1O88307 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.5 ms