Protein–RNA interactions for Protein: O70480

Vamp4, Vesicle-associated membrane protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 141 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vamp4O70480 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Vamp4O70480 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Vamp4O70480 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
Vamp4O70480 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Vamp4O70480 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Vamp4O70480 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Vamp4O70480 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Vamp4O70480 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Vamp4O70480 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Vamp4O70480 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Vamp4O70480 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
Vamp4O70480 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Vamp4O70480 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Vamp4O70480 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Vamp4O70480 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Vamp4O70480 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Vamp4O70480 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Vamp4O70480 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Vamp4O70480 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Vamp4O70480 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Vamp4O70480 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Vamp4O70480 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Vamp4O70480 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Vamp4O70480 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Vamp4O70480 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
Vamp4O70480 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Vamp4O70480 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
Vamp4O70480 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Vamp4O70480 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Vamp4O70480 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Vamp4O70480 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Vamp4O70480 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
Vamp4O70480 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
Vamp4O70480 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Vamp4O70480 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Vamp4O70480 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Vamp4O70480 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
Vamp4O70480 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Vamp4O70480 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Vamp4O70480 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC27.74■■■□□ 2.03
Vamp4O70480 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
Vamp4O70480 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Vamp4O70480 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Vamp4O70480 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
Vamp4O70480 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Vamp4O70480 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
Vamp4O70480 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Vamp4O70480 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
Vamp4O70480 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Vamp4O70480 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
Vamp4O70480 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Vamp4O70480 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Vamp4O70480 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Vamp4O70480 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Vamp4O70480 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
Vamp4O70480 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Vamp4O70480 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
Vamp4O70480 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC27.7■■■□□ 2.02
Vamp4O70480 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Vamp4O70480 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
Vamp4O70480 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
Vamp4O70480 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Vamp4O70480 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Vamp4O70480 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Vamp4O70480 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Vamp4O70480 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.69■■■□□ 2.02
Vamp4O70480 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Vamp4O70480 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
Vamp4O70480 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
Vamp4O70480 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Vamp4O70480 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
Vamp4O70480 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Vamp4O70480 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
Vamp4O70480 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Vamp4O70480 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Vamp4O70480 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Vamp4O70480 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
Vamp4O70480 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC27.66■■■□□ 2.02
Vamp4O70480 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC27.66■■■□□ 2.02
Vamp4O70480 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Vamp4O70480 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Vamp4O70480 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Vamp4O70480 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Vamp4O70480 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Vamp4O70480 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Vamp4O70480 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
Vamp4O70480 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
Vamp4O70480 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC27.64■■■□□ 2.01
Vamp4O70480 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Vamp4O70480 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Vamp4O70480 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Vamp4O70480 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Vamp4O70480 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Vamp4O70480 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Vamp4O70480 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Vamp4O70480 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Vamp4O70480 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Vamp4O70480 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Vamp4O70480 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Vamp4O70480 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 207.3 ms