Protein–RNA interactions for Protein: O70263

Lnx1, E3 ubiquitin-protein ligase LNX, mousemouse

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Length 728 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lnx1O70263 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Lnx1O70263 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Lnx1O70263 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Lnx1O70263 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Lnx1O70263 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Lnx1O70263 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Lnx1O70263 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Lnx1O70263 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Lnx1O70263 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Lnx1O70263 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Lnx1O70263 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Lnx1O70263 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Lnx1O70263 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Lnx1O70263 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Lnx1O70263 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Lnx1O70263 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Lnx1O70263 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Lnx1O70263 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Lnx1O70263 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Lnx1O70263 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Lnx1O70263 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Lnx1O70263 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Lnx1O70263 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Lnx1O70263 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
Lnx1O70263 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.64
Lnx1O70263 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Lnx1O70263 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Lnx1O70263 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Lnx1O70263 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Lnx1O70263 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Lnx1O70263 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Lnx1O70263 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Lnx1O70263 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Lnx1O70263 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Lnx1O70263 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Lnx1O70263 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Lnx1O70263 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Lnx1O70263 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Lnx1O70263 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Lnx1O70263 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Lnx1O70263 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Lnx1O70263 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Lnx1O70263 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Lnx1O70263 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Lnx1O70263 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Lnx1O70263 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Lnx1O70263 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Lnx1O70263 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Lnx1O70263 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Lnx1O70263 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Lnx1O70263 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Lnx1O70263 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Lnx1O70263 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Lnx1O70263 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Lnx1O70263 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
Lnx1O70263 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Lnx1O70263 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Lnx1O70263 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Lnx1O70263 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Lnx1O70263 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Lnx1O70263 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Lnx1O70263 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Lnx1O70263 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Lnx1O70263 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Lnx1O70263 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Lnx1O70263 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Lnx1O70263 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Lnx1O70263 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Lnx1O70263 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Lnx1O70263 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Lnx1O70263 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
Lnx1O70263 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Lnx1O70263 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Lnx1O70263 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Lnx1O70263 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Lnx1O70263 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Lnx1O70263 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Lnx1O70263 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Lnx1O70263 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Lnx1O70263 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Lnx1O70263 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
Lnx1O70263 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Lnx1O70263 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Lnx1O70263 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Lnx1O70263 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Lnx1O70263 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Lnx1O70263 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Lnx1O70263 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Lnx1O70263 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
Lnx1O70263 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Lnx1O70263 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Lnx1O70263 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Lnx1O70263 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
Lnx1O70263 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Lnx1O70263 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Lnx1O70263 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Lnx1O70263 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
Lnx1O70263 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Lnx1O70263 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Lnx1O70263 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
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