Protein–RNA interactions for Protein: O55233

Cer1, Cerberus, mousemouse

Predictions only

Length 272 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cer1O55233 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Cer1O55233 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Cer1O55233 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Cer1O55233 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Cer1O55233 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Cer1O55233 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Cer1O55233 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Cer1O55233 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Cer1O55233 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Cer1O55233 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Cer1O55233 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Cer1O55233 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Cer1O55233 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Cer1O55233 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Cer1O55233 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Cer1O55233 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Cer1O55233 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Cer1O55233 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Cer1O55233 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Cer1O55233 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Cer1O55233 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Cer1O55233 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Cer1O55233 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Cer1O55233 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Cer1O55233 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Cer1O55233 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Cer1O55233 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Cer1O55233 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Cer1O55233 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Cer1O55233 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Cer1O55233 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Cer1O55233 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Cer1O55233 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Cer1O55233 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Cer1O55233 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Cer1O55233 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Cer1O55233 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Cer1O55233 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Cer1O55233 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Cer1O55233 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Cer1O55233 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Cer1O55233 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Cer1O55233 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Cer1O55233 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Cer1O55233 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Cer1O55233 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Cer1O55233 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Cer1O55233 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Cer1O55233 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Cer1O55233 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Cer1O55233 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
Cer1O55233 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Cer1O55233 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Cer1O55233 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Cer1O55233 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Cer1O55233 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Cer1O55233 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Cer1O55233 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Cer1O55233 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Cer1O55233 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Cer1O55233 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Cer1O55233 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Cer1O55233 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Cer1O55233 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Cer1O55233 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Cer1O55233 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Cer1O55233 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Cer1O55233 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Cer1O55233 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Cer1O55233 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Cer1O55233 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Cer1O55233 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Cer1O55233 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Cer1O55233 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Cer1O55233 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Cer1O55233 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Cer1O55233 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Cer1O55233 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Cer1O55233 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Cer1O55233 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Cer1O55233 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Cer1O55233 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Cer1O55233 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Cer1O55233 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Cer1O55233 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Cer1O55233 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Cer1O55233 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Cer1O55233 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Cer1O55233 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Cer1O55233 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Cer1O55233 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Cer1O55233 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Cer1O55233 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Cer1O55233 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Cer1O55233 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Cer1O55233 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Cer1O55233 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Cer1O55233 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Cer1O55233 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Cer1O55233 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.6 ms